Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I3

CCSER1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER1Q9C0I3 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCSER1Q9C0I3 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCSER1Q9C0I3 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCSER1Q9C0I3 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCSER1Q9C0I3 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCSER1Q9C0I3 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCSER1Q9C0I3 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCSER1Q9C0I3 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCSER1Q9C0I3 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCSER1Q9C0I3 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCSER1Q9C0I3 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCSER1Q9C0I3 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCSER1Q9C0I3 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCSER1Q9C0I3 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCSER1Q9C0I3 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCSER1Q9C0I3 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCSER1Q9C0I3 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCSER1Q9C0I3 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCSER1Q9C0I3 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCSER1Q9C0I3 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCSER1Q9C0I3 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCSER1Q9C0I3 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CCSER1Q9C0I3 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCSER1Q9C0I3 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCSER1Q9C0I3 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCSER1Q9C0I3 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCSER1Q9C0I3 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CCSER1Q9C0I3 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCSER1Q9C0I3 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CCSER1Q9C0I3 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCSER1Q9C0I3 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCSER1Q9C0I3 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCSER1Q9C0I3 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCSER1Q9C0I3 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CCSER1Q9C0I3 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCSER1Q9C0I3 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCSER1Q9C0I3 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCSER1Q9C0I3 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCSER1Q9C0I3 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCSER1Q9C0I3 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCSER1Q9C0I3 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CCSER1Q9C0I3 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCSER1Q9C0I3 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCSER1Q9C0I3 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CCSER1Q9C0I3 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCSER1Q9C0I3 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCSER1Q9C0I3 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCSER1Q9C0I3 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCSER1Q9C0I3 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCSER1Q9C0I3 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCSER1Q9C0I3 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCSER1Q9C0I3 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCSER1Q9C0I3 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCSER1Q9C0I3 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCSER1Q9C0I3 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCSER1Q9C0I3 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCSER1Q9C0I3 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCSER1Q9C0I3 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCSER1Q9C0I3 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCSER1Q9C0I3 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCSER1Q9C0I3 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCSER1Q9C0I3 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCSER1Q9C0I3 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCSER1Q9C0I3 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCSER1Q9C0I3 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCSER1Q9C0I3 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCSER1Q9C0I3 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCSER1Q9C0I3 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCSER1Q9C0I3 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCSER1Q9C0I3 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCSER1Q9C0I3 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCSER1Q9C0I3 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCSER1Q9C0I3 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCSER1Q9C0I3 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCSER1Q9C0I3 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCSER1Q9C0I3 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCSER1Q9C0I3 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCSER1Q9C0I3 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCSER1Q9C0I3 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCSER1Q9C0I3 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCSER1Q9C0I3 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCSER1Q9C0I3 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCSER1Q9C0I3 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCSER1Q9C0I3 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCSER1Q9C0I3 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCSER1Q9C0I3 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCSER1Q9C0I3 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCSER1Q9C0I3 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CCSER1Q9C0I3 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CCSER1Q9C0I3 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCSER1Q9C0I3 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCSER1Q9C0I3 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCSER1Q9C0I3 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCSER1Q9C0I3 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCSER1Q9C0I3 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCSER1Q9C0I3 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCSER1Q9C0I3 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCSER1Q9C0I3 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCSER1Q9C0I3 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCSER1Q9C0I3 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
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