Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H6

KLHL4, Kelch-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL4Q9C0H6 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms