Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY60

GABARAPL3, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL3Q9BY60 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GABARAPL3Q9BY60 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GABARAPL3Q9BY60 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GABARAPL3Q9BY60 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GABARAPL3Q9BY60 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GABARAPL3Q9BY60 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GABARAPL3Q9BY60 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GABARAPL3Q9BY60 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GABARAPL3Q9BY60 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GABARAPL3Q9BY60 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GABARAPL3Q9BY60 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GABARAPL3Q9BY60 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GABARAPL3Q9BY60 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GABARAPL3Q9BY60 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GABARAPL3Q9BY60 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GABARAPL3Q9BY60 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GABARAPL3Q9BY60 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GABARAPL3Q9BY60 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GABARAPL3Q9BY60 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GABARAPL3Q9BY60 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GABARAPL3Q9BY60 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GABARAPL3Q9BY60 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GABARAPL3Q9BY60 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GABARAPL3Q9BY60 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GABARAPL3Q9BY60 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GABARAPL3Q9BY60 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GABARAPL3Q9BY60 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GABARAPL3Q9BY60 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GABARAPL3Q9BY60 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GABARAPL3Q9BY60 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GABARAPL3Q9BY60 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GABARAPL3Q9BY60 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GABARAPL3Q9BY60 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GABARAPL3Q9BY60 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GABARAPL3Q9BY60 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GABARAPL3Q9BY60 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GABARAPL3Q9BY60 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GABARAPL3Q9BY60 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GABARAPL3Q9BY60 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GABARAPL3Q9BY60 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GABARAPL3Q9BY60 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GABARAPL3Q9BY60 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GABARAPL3Q9BY60 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
GABARAPL3Q9BY60 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GABARAPL3Q9BY60 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GABARAPL3Q9BY60 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GABARAPL3Q9BY60 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GABARAPL3Q9BY60 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
GABARAPL3Q9BY60 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GABARAPL3Q9BY60 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GABARAPL3Q9BY60 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
GABARAPL3Q9BY60 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GABARAPL3Q9BY60 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GABARAPL3Q9BY60 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GABARAPL3Q9BY60 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GABARAPL3Q9BY60 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GABARAPL3Q9BY60 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GABARAPL3Q9BY60 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GABARAPL3Q9BY60 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GABARAPL3Q9BY60 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GABARAPL3Q9BY60 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GABARAPL3Q9BY60 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GABARAPL3Q9BY60 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GABARAPL3Q9BY60 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GABARAPL3Q9BY60 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GABARAPL3Q9BY60 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GABARAPL3Q9BY60 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GABARAPL3Q9BY60 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
GABARAPL3Q9BY60 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GABARAPL3Q9BY60 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GABARAPL3Q9BY60 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GABARAPL3Q9BY60 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GABARAPL3Q9BY60 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GABARAPL3Q9BY60 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GABARAPL3Q9BY60 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GABARAPL3Q9BY60 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GABARAPL3Q9BY60 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GABARAPL3Q9BY60 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GABARAPL3Q9BY60 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GABARAPL3Q9BY60 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GABARAPL3Q9BY60 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GABARAPL3Q9BY60 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
GABARAPL3Q9BY60 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GABARAPL3Q9BY60 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GABARAPL3Q9BY60 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GABARAPL3Q9BY60 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
GABARAPL3Q9BY60 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GABARAPL3Q9BY60 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
GABARAPL3Q9BY60 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GABARAPL3Q9BY60 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GABARAPL3Q9BY60 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GABARAPL3Q9BY60 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GABARAPL3Q9BY60 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GABARAPL3Q9BY60 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GABARAPL3Q9BY60 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
GABARAPL3Q9BY60 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GABARAPL3Q9BY60 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GABARAPL3Q9BY60 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GABARAPL3Q9BY60 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GABARAPL3Q9BY60 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms