Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC7Q96M83 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC7Q96M83 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC7Q96M83 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC7Q96M83 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC7Q96M83 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC7Q96M83 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC7Q96M83 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC7Q96M83 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC7Q96M83 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC7Q96M83 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC7Q96M83 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC7Q96M83 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC7Q96M83 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC7Q96M83 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC7Q96M83 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC7Q96M83 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC7Q96M83 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC7Q96M83 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC7Q96M83 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC7Q96M83 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC7Q96M83 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC7Q96M83 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC7Q96M83 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC7Q96M83 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC7Q96M83 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC7Q96M83 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC7Q96M83 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC7Q96M83 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC7Q96M83 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC7Q96M83 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC7Q96M83 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC7Q96M83 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC7Q96M83 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC7Q96M83 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC7Q96M83 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC7Q96M83 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC7Q96M83 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC7Q96M83 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC7Q96M83 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC7Q96M83 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC7Q96M83 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC7Q96M83 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC7Q96M83 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC7Q96M83 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC7Q96M83 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC7Q96M83 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC7Q96M83 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC7Q96M83 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC7Q96M83 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC7Q96M83 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC7Q96M83 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC7Q96M83 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC7Q96M83 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC7Q96M83 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC7Q96M83 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC7Q96M83 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC7Q96M83 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC7Q96M83 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC7Q96M83 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC7Q96M83 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
CCDC7Q96M83 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
CCDC7Q96M83 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
CCDC7Q96M83 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
CCDC7Q96M83 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
CCDC7Q96M83 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
CCDC7Q96M83 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC7Q96M83 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC7Q96M83 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC7Q96M83 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC7Q96M83 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC7Q96M83 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC7Q96M83 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC7Q96M83 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC7Q96M83 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC7Q96M83 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC7Q96M83 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC7Q96M83 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC7Q96M83 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC7Q96M83 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC7Q96M83 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC7Q96M83 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC7Q96M83 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC7Q96M83 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC7Q96M83 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC7Q96M83 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC7Q96M83 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC7Q96M83 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC7Q96M83 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC7Q96M83 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC7Q96M83 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC7Q96M83 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC7Q96M83 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC7Q96M83 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC7Q96M83 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC7Q96M83 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC7Q96M83 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC7Q96M83 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC7Q96M83 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC7Q96M83 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms