Protein–RNA interactions for Protein: Q969W0

SPTSSA, Serine palmitoyltransferase small subunit A, humanhuman

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Length 71 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSAQ969W0 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SPTSSAQ969W0 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPTSSAQ969W0 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPTSSAQ969W0 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPTSSAQ969W0 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPTSSAQ969W0 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPTSSAQ969W0 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPTSSAQ969W0 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPTSSAQ969W0 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPTSSAQ969W0 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPTSSAQ969W0 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPTSSAQ969W0 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPTSSAQ969W0 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPTSSAQ969W0 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPTSSAQ969W0 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPTSSAQ969W0 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPTSSAQ969W0 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPTSSAQ969W0 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPTSSAQ969W0 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPTSSAQ969W0 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPTSSAQ969W0 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SPTSSAQ969W0 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPTSSAQ969W0 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPTSSAQ969W0 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPTSSAQ969W0 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPTSSAQ969W0 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPTSSAQ969W0 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPTSSAQ969W0 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPTSSAQ969W0 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPTSSAQ969W0 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPTSSAQ969W0 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SPTSSAQ969W0 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPTSSAQ969W0 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPTSSAQ969W0 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SPTSSAQ969W0 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPTSSAQ969W0 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPTSSAQ969W0 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPTSSAQ969W0 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPTSSAQ969W0 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPTSSAQ969W0 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPTSSAQ969W0 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPTSSAQ969W0 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPTSSAQ969W0 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPTSSAQ969W0 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPTSSAQ969W0 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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SPTSSAQ969W0 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPTSSAQ969W0 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPTSSAQ969W0 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SPTSSAQ969W0 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPTSSAQ969W0 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPTSSAQ969W0 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SPTSSAQ969W0 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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SPTSSAQ969W0 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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SPTSSAQ969W0 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPTSSAQ969W0 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPTSSAQ969W0 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPTSSAQ969W0 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPTSSAQ969W0 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPTSSAQ969W0 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPTSSAQ969W0 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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SPTSSAQ969W0 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPTSSAQ969W0 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPTSSAQ969W0 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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SPTSSAQ969W0 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
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SPTSSAQ969W0 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
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SPTSSAQ969W0 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SPTSSAQ969W0 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SPTSSAQ969W0 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SPTSSAQ969W0 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
SPTSSAQ969W0 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SPTSSAQ969W0 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SPTSSAQ969W0 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
SPTSSAQ969W0 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SPTSSAQ969W0 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SPTSSAQ969W0 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SPTSSAQ969W0 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SPTSSAQ969W0 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SPTSSAQ969W0 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SPTSSAQ969W0 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SPTSSAQ969W0 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SPTSSAQ969W0 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SPTSSAQ969W0 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SPTSSAQ969W0 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SPTSSAQ969W0 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
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