Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW8

TTC21A, Tetratricopeptide repeat protein 21A, humanhuman

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC21AQ8NDW8 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TTC21AQ8NDW8 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TTC21AQ8NDW8 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TTC21AQ8NDW8 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TTC21AQ8NDW8 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TTC21AQ8NDW8 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TTC21AQ8NDW8 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TTC21AQ8NDW8 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TTC21AQ8NDW8 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TTC21AQ8NDW8 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TTC21AQ8NDW8 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TTC21AQ8NDW8 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TTC21AQ8NDW8 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TTC21AQ8NDW8 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TTC21AQ8NDW8 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TTC21AQ8NDW8 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TTC21AQ8NDW8 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TTC21AQ8NDW8 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TTC21AQ8NDW8 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TTC21AQ8NDW8 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TTC21AQ8NDW8 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TTC21AQ8NDW8 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TTC21AQ8NDW8 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TTC21AQ8NDW8 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TTC21AQ8NDW8 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TTC21AQ8NDW8 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TTC21AQ8NDW8 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TTC21AQ8NDW8 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TTC21AQ8NDW8 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TTC21AQ8NDW8 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TTC21AQ8NDW8 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TTC21AQ8NDW8 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TTC21AQ8NDW8 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TTC21AQ8NDW8 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TTC21AQ8NDW8 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TTC21AQ8NDW8 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TTC21AQ8NDW8 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TTC21AQ8NDW8 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TTC21AQ8NDW8 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TTC21AQ8NDW8 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TTC21AQ8NDW8 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TTC21AQ8NDW8 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TTC21AQ8NDW8 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TTC21AQ8NDW8 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TTC21AQ8NDW8 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TTC21AQ8NDW8 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TTC21AQ8NDW8 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TTC21AQ8NDW8 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TTC21AQ8NDW8 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TTC21AQ8NDW8 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TTC21AQ8NDW8 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TTC21AQ8NDW8 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TTC21AQ8NDW8 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TTC21AQ8NDW8 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TTC21AQ8NDW8 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TTC21AQ8NDW8 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TTC21AQ8NDW8 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TTC21AQ8NDW8 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TTC21AQ8NDW8 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TTC21AQ8NDW8 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TTC21AQ8NDW8 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TTC21AQ8NDW8 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TTC21AQ8NDW8 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TTC21AQ8NDW8 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TTC21AQ8NDW8 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TTC21AQ8NDW8 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TTC21AQ8NDW8 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TTC21AQ8NDW8 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TTC21AQ8NDW8 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TTC21AQ8NDW8 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TTC21AQ8NDW8 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TTC21AQ8NDW8 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TTC21AQ8NDW8 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TTC21AQ8NDW8 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TTC21AQ8NDW8 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TTC21AQ8NDW8 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TTC21AQ8NDW8 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TTC21AQ8NDW8 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TTC21AQ8NDW8 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TTC21AQ8NDW8 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TTC21AQ8NDW8 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TTC21AQ8NDW8 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TTC21AQ8NDW8 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TTC21AQ8NDW8 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TTC21AQ8NDW8 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TTC21AQ8NDW8 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TTC21AQ8NDW8 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TTC21AQ8NDW8 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TTC21AQ8NDW8 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TTC21AQ8NDW8 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TTC21AQ8NDW8 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TTC21AQ8NDW8 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TTC21AQ8NDW8 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TTC21AQ8NDW8 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TTC21AQ8NDW8 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TTC21AQ8NDW8 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TTC21AQ8NDW8 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TTC21AQ8NDW8 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TTC21AQ8NDW8 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TTC21AQ8NDW8 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms