Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7C7

RNF148, RING finger protein 148, humanhuman

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Length 305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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RNF148Q8N7C7 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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RNF148Q8N7C7 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF148Q8N7C7 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF148Q8N7C7 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF148Q8N7C7 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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RNF148Q8N7C7 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF148Q8N7C7 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF148Q8N7C7 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF148Q8N7C7 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF148Q8N7C7 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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RNF148Q8N7C7 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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RNF148Q8N7C7 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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RNF148Q8N7C7 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF148Q8N7C7 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF148Q8N7C7 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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RNF148Q8N7C7 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF148Q8N7C7 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF148Q8N7C7 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNF148Q8N7C7 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNF148Q8N7C7 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNF148Q8N7C7 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNF148Q8N7C7 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNF148Q8N7C7 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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