Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW60

PCSK4, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 4, humanhuman

Predictions only

Length 755 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK4Q6UW60 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCSK4Q6UW60 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCSK4Q6UW60 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCSK4Q6UW60 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PCSK4Q6UW60 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCSK4Q6UW60 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PCSK4Q6UW60 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PCSK4Q6UW60 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCSK4Q6UW60 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCSK4Q6UW60 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCSK4Q6UW60 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCSK4Q6UW60 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCSK4Q6UW60 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCSK4Q6UW60 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCSK4Q6UW60 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCSK4Q6UW60 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCSK4Q6UW60 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCSK4Q6UW60 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCSK4Q6UW60 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCSK4Q6UW60 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCSK4Q6UW60 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCSK4Q6UW60 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCSK4Q6UW60 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCSK4Q6UW60 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCSK4Q6UW60 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCSK4Q6UW60 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCSK4Q6UW60 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCSK4Q6UW60 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCSK4Q6UW60 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCSK4Q6UW60 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCSK4Q6UW60 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCSK4Q6UW60 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCSK4Q6UW60 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCSK4Q6UW60 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCSK4Q6UW60 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCSK4Q6UW60 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCSK4Q6UW60 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCSK4Q6UW60 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCSK4Q6UW60 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCSK4Q6UW60 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCSK4Q6UW60 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PCSK4Q6UW60 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PCSK4Q6UW60 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PCSK4Q6UW60 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCSK4Q6UW60 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCSK4Q6UW60 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCSK4Q6UW60 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCSK4Q6UW60 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCSK4Q6UW60 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCSK4Q6UW60 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCSK4Q6UW60 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCSK4Q6UW60 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCSK4Q6UW60 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCSK4Q6UW60 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCSK4Q6UW60 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCSK4Q6UW60 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCSK4Q6UW60 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCSK4Q6UW60 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCSK4Q6UW60 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCSK4Q6UW60 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCSK4Q6UW60 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCSK4Q6UW60 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCSK4Q6UW60 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCSK4Q6UW60 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCSK4Q6UW60 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCSK4Q6UW60 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCSK4Q6UW60 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCSK4Q6UW60 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCSK4Q6UW60 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCSK4Q6UW60 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCSK4Q6UW60 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCSK4Q6UW60 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCSK4Q6UW60 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCSK4Q6UW60 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCSK4Q6UW60 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCSK4Q6UW60 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCSK4Q6UW60 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PCSK4Q6UW60 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCSK4Q6UW60 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCSK4Q6UW60 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PCSK4Q6UW60 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PCSK4Q6UW60 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCSK4Q6UW60 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCSK4Q6UW60 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCSK4Q6UW60 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PCSK4Q6UW60 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PCSK4Q6UW60 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCSK4Q6UW60 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PCSK4Q6UW60 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCSK4Q6UW60 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCSK4Q6UW60 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCSK4Q6UW60 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCSK4Q6UW60 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCSK4Q6UW60 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCSK4Q6UW60 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCSK4Q6UW60 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCSK4Q6UW60 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCSK4Q6UW60 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCSK4Q6UW60 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCSK4Q6UW60 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms