Protein–RNA interactions for Protein: Q5U3C3

TMEM164, Transmembrane protein 164, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM164Q5U3C3 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM164Q5U3C3 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM164Q5U3C3 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM164Q5U3C3 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM164Q5U3C3 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM164Q5U3C3 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM164Q5U3C3 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM164Q5U3C3 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM164Q5U3C3 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM164Q5U3C3 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM164Q5U3C3 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM164Q5U3C3 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM164Q5U3C3 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM164Q5U3C3 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM164Q5U3C3 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM164Q5U3C3 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM164Q5U3C3 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM164Q5U3C3 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM164Q5U3C3 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM164Q5U3C3 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM164Q5U3C3 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM164Q5U3C3 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM164Q5U3C3 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM164Q5U3C3 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM164Q5U3C3 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM164Q5U3C3 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM164Q5U3C3 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM164Q5U3C3 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM164Q5U3C3 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM164Q5U3C3 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM164Q5U3C3 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM164Q5U3C3 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM164Q5U3C3 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM164Q5U3C3 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM164Q5U3C3 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM164Q5U3C3 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM164Q5U3C3 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM164Q5U3C3 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM164Q5U3C3 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM164Q5U3C3 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM164Q5U3C3 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM164Q5U3C3 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM164Q5U3C3 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM164Q5U3C3 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM164Q5U3C3 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM164Q5U3C3 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM164Q5U3C3 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM164Q5U3C3 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM164Q5U3C3 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM164Q5U3C3 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM164Q5U3C3 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM164Q5U3C3 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM164Q5U3C3 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM164Q5U3C3 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM164Q5U3C3 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM164Q5U3C3 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM164Q5U3C3 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM164Q5U3C3 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM164Q5U3C3 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM164Q5U3C3 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM164Q5U3C3 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM164Q5U3C3 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM164Q5U3C3 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM164Q5U3C3 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM164Q5U3C3 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM164Q5U3C3 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM164Q5U3C3 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM164Q5U3C3 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM164Q5U3C3 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM164Q5U3C3 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM164Q5U3C3 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM164Q5U3C3 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM164Q5U3C3 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM164Q5U3C3 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM164Q5U3C3 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM164Q5U3C3 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM164Q5U3C3 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM164Q5U3C3 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM164Q5U3C3 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM164Q5U3C3 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM164Q5U3C3 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM164Q5U3C3 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM164Q5U3C3 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM164Q5U3C3 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM164Q5U3C3 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM164Q5U3C3 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM164Q5U3C3 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM164Q5U3C3 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM164Q5U3C3 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM164Q5U3C3 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM164Q5U3C3 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM164Q5U3C3 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM164Q5U3C3 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM164Q5U3C3 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM164Q5U3C3 BRSK1-206ENST00000590333 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM164Q5U3C3 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM164Q5U3C3 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM164Q5U3C3 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM164Q5U3C3 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM164Q5U3C3 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms