Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2W1

PDZK1, Na(+)/H(+) exchange regulatory cofactor NHE-RF3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZK1Q5T2W1 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDZK1Q5T2W1 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PDZK1Q5T2W1 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDZK1Q5T2W1 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDZK1Q5T2W1 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDZK1Q5T2W1 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDZK1Q5T2W1 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDZK1Q5T2W1 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDZK1Q5T2W1 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDZK1Q5T2W1 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDZK1Q5T2W1 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PDZK1Q5T2W1 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDZK1Q5T2W1 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDZK1Q5T2W1 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDZK1Q5T2W1 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDZK1Q5T2W1 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDZK1Q5T2W1 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDZK1Q5T2W1 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDZK1Q5T2W1 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDZK1Q5T2W1 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDZK1Q5T2W1 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDZK1Q5T2W1 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDZK1Q5T2W1 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDZK1Q5T2W1 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDZK1Q5T2W1 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDZK1Q5T2W1 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDZK1Q5T2W1 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDZK1Q5T2W1 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDZK1Q5T2W1 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDZK1Q5T2W1 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDZK1Q5T2W1 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDZK1Q5T2W1 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDZK1Q5T2W1 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDZK1Q5T2W1 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDZK1Q5T2W1 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PDZK1Q5T2W1 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PDZK1Q5T2W1 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PDZK1Q5T2W1 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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PDZK1Q5T2W1 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDZK1Q5T2W1 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDZK1Q5T2W1 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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PDZK1Q5T2W1 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDZK1Q5T2W1 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDZK1Q5T2W1 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDZK1Q5T2W1 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDZK1Q5T2W1 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDZK1Q5T2W1 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDZK1Q5T2W1 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDZK1Q5T2W1 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDZK1Q5T2W1 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PDZK1Q5T2W1 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDZK1Q5T2W1 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDZK1Q5T2W1 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDZK1Q5T2W1 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDZK1Q5T2W1 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDZK1Q5T2W1 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDZK1Q5T2W1 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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PDZK1Q5T2W1 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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PDZK1Q5T2W1 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDZK1Q5T2W1 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDZK1Q5T2W1 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDZK1Q5T2W1 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDZK1Q5T2W1 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDZK1Q5T2W1 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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PDZK1Q5T2W1 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDZK1Q5T2W1 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDZK1Q5T2W1 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDZK1Q5T2W1 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDZK1Q5T2W1 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDZK1Q5T2W1 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDZK1Q5T2W1 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDZK1Q5T2W1 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDZK1Q5T2W1 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDZK1Q5T2W1 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDZK1Q5T2W1 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDZK1Q5T2W1 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PDZK1Q5T2W1 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDZK1Q5T2W1 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDZK1Q5T2W1 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDZK1Q5T2W1 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PDZK1Q5T2W1 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDZK1Q5T2W1 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDZK1Q5T2W1 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDZK1Q5T2W1 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDZK1Q5T2W1 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDZK1Q5T2W1 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDZK1Q5T2W1 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PDZK1Q5T2W1 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDZK1Q5T2W1 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDZK1Q5T2W1 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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