Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE5

NUP188, Nucleoporin NUP188 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP188Q5SRE5 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NUP188Q5SRE5 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NUP188Q5SRE5 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NUP188Q5SRE5 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NUP188Q5SRE5 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NUP188Q5SRE5 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NUP188Q5SRE5 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
NUP188Q5SRE5 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
NUP188Q5SRE5 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
NUP188Q5SRE5 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
NUP188Q5SRE5 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
NUP188Q5SRE5 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
NUP188Q5SRE5 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NUP188Q5SRE5 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NUP188Q5SRE5 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NUP188Q5SRE5 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NUP188Q5SRE5 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NUP188Q5SRE5 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NUP188Q5SRE5 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NUP188Q5SRE5 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NUP188Q5SRE5 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
NUP188Q5SRE5 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NUP188Q5SRE5 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NUP188Q5SRE5 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NUP188Q5SRE5 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NUP188Q5SRE5 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NUP188Q5SRE5 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NUP188Q5SRE5 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
NUP188Q5SRE5 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NUP188Q5SRE5 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NUP188Q5SRE5 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NUP188Q5SRE5 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NUP188Q5SRE5 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NUP188Q5SRE5 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NUP188Q5SRE5 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NUP188Q5SRE5 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NUP188Q5SRE5 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NUP188Q5SRE5 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NUP188Q5SRE5 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NUP188Q5SRE5 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NUP188Q5SRE5 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NUP188Q5SRE5 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NUP188Q5SRE5 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NUP188Q5SRE5 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NUP188Q5SRE5 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NUP188Q5SRE5 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NUP188Q5SRE5 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
NUP188Q5SRE5 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NUP188Q5SRE5 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
NUP188Q5SRE5 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NUP188Q5SRE5 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NUP188Q5SRE5 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
NUP188Q5SRE5 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
NUP188Q5SRE5 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NUP188Q5SRE5 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
NUP188Q5SRE5 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
NUP188Q5SRE5 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NUP188Q5SRE5 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC21■□□□□ 0.95
NUP188Q5SRE5 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NUP188Q5SRE5 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NUP188Q5SRE5 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NUP188Q5SRE5 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NUP188Q5SRE5 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
NUP188Q5SRE5 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
NUP188Q5SRE5 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC21■□□□□ 0.95
NUP188Q5SRE5 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
NUP188Q5SRE5 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NUP188Q5SRE5 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
NUP188Q5SRE5 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
NUP188Q5SRE5 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC21■□□□□ 0.95
NUP188Q5SRE5 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
NUP188Q5SRE5 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
NUP188Q5SRE5 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC21■□□□□ 0.95
NUP188Q5SRE5 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
NUP188Q5SRE5 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
NUP188Q5SRE5 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC21■□□□□ 0.95
NUP188Q5SRE5 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NUP188Q5SRE5 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NUP188Q5SRE5 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
NUP188Q5SRE5 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
NUP188Q5SRE5 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NUP188Q5SRE5 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
NUP188Q5SRE5 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
NUP188Q5SRE5 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
NUP188Q5SRE5 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NUP188Q5SRE5 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NUP188Q5SRE5 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NUP188Q5SRE5 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NUP188Q5SRE5 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NUP188Q5SRE5 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NUP188Q5SRE5 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NUP188Q5SRE5 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NUP188Q5SRE5 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NUP188Q5SRE5 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NUP188Q5SRE5 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NUP188Q5SRE5 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NUP188Q5SRE5 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NUP188Q5SRE5 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NUP188Q5SRE5 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NUP188Q5SRE5 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms