Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZG55

GREB1, Protein GREB1, humanhuman

Predictions only

Length 1,949 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GREB1Q4ZG55 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GREB1Q4ZG55 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
GREB1Q4ZG55 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GREB1Q4ZG55 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GREB1Q4ZG55 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GREB1Q4ZG55 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GREB1Q4ZG55 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GREB1Q4ZG55 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GREB1Q4ZG55 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GREB1Q4ZG55 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GREB1Q4ZG55 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GREB1Q4ZG55 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GREB1Q4ZG55 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
GREB1Q4ZG55 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GREB1Q4ZG55 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GREB1Q4ZG55 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GREB1Q4ZG55 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GREB1Q4ZG55 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GREB1Q4ZG55 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GREB1Q4ZG55 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
GREB1Q4ZG55 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
GREB1Q4ZG55 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GREB1Q4ZG55 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GREB1Q4ZG55 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GREB1Q4ZG55 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GREB1Q4ZG55 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GREB1Q4ZG55 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GREB1Q4ZG55 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GREB1Q4ZG55 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GREB1Q4ZG55 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GREB1Q4ZG55 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GREB1Q4ZG55 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GREB1Q4ZG55 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GREB1Q4ZG55 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GREB1Q4ZG55 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GREB1Q4ZG55 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GREB1Q4ZG55 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GREB1Q4ZG55 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GREB1Q4ZG55 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GREB1Q4ZG55 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
GREB1Q4ZG55 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GREB1Q4ZG55 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
GREB1Q4ZG55 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
GREB1Q4ZG55 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
GREB1Q4ZG55 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
GREB1Q4ZG55 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GREB1Q4ZG55 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GREB1Q4ZG55 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GREB1Q4ZG55 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GREB1Q4ZG55 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GREB1Q4ZG55 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GREB1Q4ZG55 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GREB1Q4ZG55 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GREB1Q4ZG55 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GREB1Q4ZG55 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GREB1Q4ZG55 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GREB1Q4ZG55 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GREB1Q4ZG55 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GREB1Q4ZG55 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GREB1Q4ZG55 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GREB1Q4ZG55 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GREB1Q4ZG55 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GREB1Q4ZG55 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GREB1Q4ZG55 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GREB1Q4ZG55 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GREB1Q4ZG55 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GREB1Q4ZG55 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GREB1Q4ZG55 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GREB1Q4ZG55 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GREB1Q4ZG55 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GREB1Q4ZG55 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GREB1Q4ZG55 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GREB1Q4ZG55 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GREB1Q4ZG55 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GREB1Q4ZG55 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GREB1Q4ZG55 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GREB1Q4ZG55 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GREB1Q4ZG55 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GREB1Q4ZG55 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GREB1Q4ZG55 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GREB1Q4ZG55 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GREB1Q4ZG55 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GREB1Q4ZG55 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GREB1Q4ZG55 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GREB1Q4ZG55 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GREB1Q4ZG55 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GREB1Q4ZG55 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GREB1Q4ZG55 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GREB1Q4ZG55 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GREB1Q4ZG55 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GREB1Q4ZG55 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GREB1Q4ZG55 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GREB1Q4ZG55 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GREB1Q4ZG55 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GREB1Q4ZG55 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GREB1Q4ZG55 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GREB1Q4ZG55 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GREB1Q4ZG55 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GREB1Q4ZG55 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GREB1Q4ZG55 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms