Protein–RNA interactions for Protein: Q33E94

RFX4, Transcription factor RFX4, humanhuman

Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX4Q33E94 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFX4Q33E94 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFX4Q33E94 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFX4Q33E94 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFX4Q33E94 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFX4Q33E94 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFX4Q33E94 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFX4Q33E94 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFX4Q33E94 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RFX4Q33E94 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFX4Q33E94 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFX4Q33E94 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFX4Q33E94 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFX4Q33E94 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFX4Q33E94 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFX4Q33E94 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFX4Q33E94 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFX4Q33E94 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFX4Q33E94 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFX4Q33E94 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFX4Q33E94 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFX4Q33E94 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFX4Q33E94 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFX4Q33E94 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFX4Q33E94 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RFX4Q33E94 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFX4Q33E94 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFX4Q33E94 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFX4Q33E94 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFX4Q33E94 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFX4Q33E94 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RFX4Q33E94 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFX4Q33E94 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFX4Q33E94 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFX4Q33E94 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFX4Q33E94 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFX4Q33E94 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RFX4Q33E94 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFX4Q33E94 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFX4Q33E94 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFX4Q33E94 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFX4Q33E94 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFX4Q33E94 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFX4Q33E94 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFX4Q33E94 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFX4Q33E94 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RFX4Q33E94 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RFX4Q33E94 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RFX4Q33E94 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RFX4Q33E94 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RFX4Q33E94 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RFX4Q33E94 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RFX4Q33E94 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RFX4Q33E94 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RFX4Q33E94 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RFX4Q33E94 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RFX4Q33E94 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RFX4Q33E94 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RFX4Q33E94 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RFX4Q33E94 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RFX4Q33E94 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RFX4Q33E94 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RFX4Q33E94 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RFX4Q33E94 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RFX4Q33E94 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RFX4Q33E94 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RFX4Q33E94 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RFX4Q33E94 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RFX4Q33E94 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RFX4Q33E94 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RFX4Q33E94 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RFX4Q33E94 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RFX4Q33E94 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RFX4Q33E94 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RFX4Q33E94 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RFX4Q33E94 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RFX4Q33E94 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RFX4Q33E94 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RFX4Q33E94 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RFX4Q33E94 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RFX4Q33E94 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RFX4Q33E94 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RFX4Q33E94 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RFX4Q33E94 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RFX4Q33E94 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RFX4Q33E94 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
RFX4Q33E94 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RFX4Q33E94 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFX4Q33E94 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFX4Q33E94 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFX4Q33E94 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFX4Q33E94 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFX4Q33E94 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFX4Q33E94 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFX4Q33E94 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFX4Q33E94 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFX4Q33E94 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFX4Q33E94 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFX4Q33E94 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFX4Q33E94 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms