Protein–RNA interactions for Protein: Q30KQ1

DEFB133, Beta-defensin 133, humanhuman

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Length 61 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFB133Q30KQ1 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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DEFB133Q30KQ1 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DEFB133Q30KQ1 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DEFB133Q30KQ1 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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DEFB133Q30KQ1 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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DEFB133Q30KQ1 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DEFB133Q30KQ1 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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DEFB133Q30KQ1 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DEFB133Q30KQ1 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DEFB133Q30KQ1 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DEFB133Q30KQ1 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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