Protein–RNA interactions for Protein: Q16695

HIST3H3, Histone H3.1t, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST3H3Q16695 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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