Protein–RNA interactions for Protein: Q15198

PDGFRL, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRLQ15198 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PDGFRLQ15198 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PDGFRLQ15198 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PDGFRLQ15198 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PDGFRLQ15198 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PDGFRLQ15198 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PDGFRLQ15198 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PDGFRLQ15198 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PDGFRLQ15198 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PDGFRLQ15198 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
PDGFRLQ15198 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
PDGFRLQ15198 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDGFRLQ15198 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDGFRLQ15198 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDGFRLQ15198 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDGFRLQ15198 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDGFRLQ15198 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDGFRLQ15198 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
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