Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGB3BPQ13352 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGB3BPQ13352 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGB3BPQ13352 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGB3BPQ13352 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGB3BPQ13352 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGB3BPQ13352 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGB3BPQ13352 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
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ITGB3BPQ13352 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGB3BPQ13352 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGB3BPQ13352 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGB3BPQ13352 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGB3BPQ13352 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGB3BPQ13352 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGB3BPQ13352 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGB3BPQ13352 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGB3BPQ13352 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGB3BPQ13352 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGB3BPQ13352 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGB3BPQ13352 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGB3BPQ13352 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
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ITGB3BPQ13352 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGB3BPQ13352 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGB3BPQ13352 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGB3BPQ13352 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGB3BPQ13352 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGB3BPQ13352 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGB3BPQ13352 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGB3BPQ13352 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGB3BPQ13352 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGB3BPQ13352 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGB3BPQ13352 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGB3BPQ13352 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGB3BPQ13352 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGB3BPQ13352 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGB3BPQ13352 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGB3BPQ13352 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGB3BPQ13352 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGB3BPQ13352 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGB3BPQ13352 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGB3BPQ13352 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGB3BPQ13352 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
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ITGB3BPQ13352 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
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ITGB3BPQ13352 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGB3BPQ13352 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGB3BPQ13352 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGB3BPQ13352 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGB3BPQ13352 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGB3BPQ13352 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
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ITGB3BPQ13352 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
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ITGB3BPQ13352 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
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ITGB3BPQ13352 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
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ITGB3BPQ13352 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
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ITGB3BPQ13352 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGB3BPQ13352 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
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ITGB3BPQ13352 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGB3BPQ13352 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGB3BPQ13352 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
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ITGB3BPQ13352 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGB3BPQ13352 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGB3BPQ13352 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGB3BPQ13352 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGB3BPQ13352 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGB3BPQ13352 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGB3BPQ13352 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGB3BPQ13352 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGB3BPQ13352 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGB3BPQ13352 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGB3BPQ13352 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGB3BPQ13352 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGB3BPQ13352 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGB3BPQ13352 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGB3BPQ13352 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGB3BPQ13352 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGB3BPQ13352 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGB3BPQ13352 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGB3BPQ13352 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGB3BPQ13352 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGB3BPQ13352 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGB3BPQ13352 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGB3BPQ13352 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGB3BPQ13352 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGB3BPQ13352 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGB3BPQ13352 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
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