Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC15Q0P6D6 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC15Q0P6D6 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC15Q0P6D6 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC15Q0P6D6 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC15Q0P6D6 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC15Q0P6D6 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC15Q0P6D6 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC15Q0P6D6 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC15Q0P6D6 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC15Q0P6D6 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC15Q0P6D6 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC15Q0P6D6 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC15Q0P6D6 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC15Q0P6D6 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC15Q0P6D6 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC15Q0P6D6 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC15Q0P6D6 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC15Q0P6D6 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC15Q0P6D6 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC15Q0P6D6 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC15Q0P6D6 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC15Q0P6D6 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC15Q0P6D6 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC15Q0P6D6 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC15Q0P6D6 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC15Q0P6D6 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC15Q0P6D6 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC15Q0P6D6 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC15Q0P6D6 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC15Q0P6D6 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC15Q0P6D6 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC15Q0P6D6 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC15Q0P6D6 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC15Q0P6D6 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC15Q0P6D6 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC15Q0P6D6 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC15Q0P6D6 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC15Q0P6D6 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC15Q0P6D6 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC15Q0P6D6 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC15Q0P6D6 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC15Q0P6D6 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC15Q0P6D6 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC15Q0P6D6 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC15Q0P6D6 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC15Q0P6D6 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC15Q0P6D6 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC15Q0P6D6 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC15Q0P6D6 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC15Q0P6D6 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC15Q0P6D6 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC15Q0P6D6 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC15Q0P6D6 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC15Q0P6D6 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC15Q0P6D6 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC15Q0P6D6 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC15Q0P6D6 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC15Q0P6D6 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC15Q0P6D6 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC15Q0P6D6 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC15Q0P6D6 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC15Q0P6D6 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC15Q0P6D6 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC15Q0P6D6 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC15Q0P6D6 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC15Q0P6D6 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC15Q0P6D6 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC15Q0P6D6 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC15Q0P6D6 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC15Q0P6D6 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC15Q0P6D6 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC15Q0P6D6 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC15Q0P6D6 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC15Q0P6D6 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC15Q0P6D6 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC15Q0P6D6 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC15Q0P6D6 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC15Q0P6D6 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC15Q0P6D6 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC15Q0P6D6 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC15Q0P6D6 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC15Q0P6D6 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC15Q0P6D6 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC15Q0P6D6 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC15Q0P6D6 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC15Q0P6D6 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC15Q0P6D6 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC15Q0P6D6 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC15Q0P6D6 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC15Q0P6D6 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC15Q0P6D6 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC15Q0P6D6 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC15Q0P6D6 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC15Q0P6D6 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC15Q0P6D6 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC15Q0P6D6 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC15Q0P6D6 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC15Q0P6D6 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC15Q0P6D6 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms