Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms