Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms