Protein–RNA interactions for Protein: P78337

PITX1, Pituitary homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1P78337 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PITX1P78337 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PITX1P78337 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PITX1P78337 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PITX1P78337 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PITX1P78337 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PITX1P78337 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PITX1P78337 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PITX1P78337 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PITX1P78337 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PITX1P78337 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PITX1P78337 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PITX1P78337 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PITX1P78337 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PITX1P78337 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PITX1P78337 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PITX1P78337 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PITX1P78337 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PITX1P78337 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PITX1P78337 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PITX1P78337 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PITX1P78337 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PITX1P78337 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PITX1P78337 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PITX1P78337 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PITX1P78337 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PITX1P78337 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PITX1P78337 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PITX1P78337 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PITX1P78337 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PITX1P78337 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PITX1P78337 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PITX1P78337 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PITX1P78337 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PITX1P78337 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PITX1P78337 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PITX1P78337 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PITX1P78337 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PITX1P78337 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PITX1P78337 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PITX1P78337 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PITX1P78337 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PITX1P78337 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PITX1P78337 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PITX1P78337 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PITX1P78337 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PITX1P78337 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PITX1P78337 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PITX1P78337 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PITX1P78337 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PITX1P78337 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PITX1P78337 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PITX1P78337 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PITX1P78337 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PITX1P78337 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PITX1P78337 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PITX1P78337 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PITX1P78337 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PITX1P78337 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PITX1P78337 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PITX1P78337 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PITX1P78337 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PITX1P78337 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PITX1P78337 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PITX1P78337 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PITX1P78337 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PITX1P78337 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PITX1P78337 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PITX1P78337 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PITX1P78337 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PITX1P78337 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PITX1P78337 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PITX1P78337 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PITX1P78337 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PITX1P78337 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PITX1P78337 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PITX1P78337 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PITX1P78337 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PITX1P78337 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PITX1P78337 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
PITX1P78337 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
PITX1P78337 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PITX1P78337 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PITX1P78337 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PITX1P78337 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PITX1P78337 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PITX1P78337 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PITX1P78337 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PITX1P78337 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PITX1P78337 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PITX1P78337 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PITX1P78337 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PITX1P78337 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PITX1P78337 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PITX1P78337 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PITX1P78337 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PITX1P78337 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PITX1P78337 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PITX1P78337 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PITX1P78337 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms