Protein–RNA interactions for Protein: P68366

TUBA4A, Tubulin alpha-4A chain, humanhuman

Predictions only

Length 448 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA4AP68366 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TUBA4AP68366 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TUBA4AP68366 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TUBA4AP68366 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TUBA4AP68366 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TUBA4AP68366 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TUBA4AP68366 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TUBA4AP68366 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TUBA4AP68366 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TUBA4AP68366 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TUBA4AP68366 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TUBA4AP68366 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TUBA4AP68366 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TUBA4AP68366 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TUBA4AP68366 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TUBA4AP68366 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TUBA4AP68366 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TUBA4AP68366 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TUBA4AP68366 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TUBA4AP68366 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TUBA4AP68366 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TUBA4AP68366 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TUBA4AP68366 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TUBA4AP68366 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TUBA4AP68366 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TUBA4AP68366 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TUBA4AP68366 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TUBA4AP68366 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TUBA4AP68366 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TUBA4AP68366 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TUBA4AP68366 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TUBA4AP68366 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBA4AP68366 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBA4AP68366 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBA4AP68366 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBA4AP68366 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBA4AP68366 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBA4AP68366 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBA4AP68366 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBA4AP68366 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBA4AP68366 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBA4AP68366 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBA4AP68366 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBA4AP68366 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBA4AP68366 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBA4AP68366 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBA4AP68366 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBA4AP68366 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBA4AP68366 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBA4AP68366 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBA4AP68366 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBA4AP68366 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBA4AP68366 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBA4AP68366 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBA4AP68366 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBA4AP68366 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBA4AP68366 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBA4AP68366 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBA4AP68366 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBA4AP68366 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBA4AP68366 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBA4AP68366 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBA4AP68366 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBA4AP68366 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBA4AP68366 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBA4AP68366 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBA4AP68366 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBA4AP68366 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBA4AP68366 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBA4AP68366 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBA4AP68366 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBA4AP68366 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBA4AP68366 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBA4AP68366 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBA4AP68366 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBA4AP68366 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBA4AP68366 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBA4AP68366 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBA4AP68366 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBA4AP68366 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBA4AP68366 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBA4AP68366 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBA4AP68366 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBA4AP68366 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBA4AP68366 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBA4AP68366 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBA4AP68366 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBA4AP68366 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBA4AP68366 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBA4AP68366 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBA4AP68366 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBA4AP68366 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBA4AP68366 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBA4AP68366 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBA4AP68366 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBA4AP68366 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBA4AP68366 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBA4AP68366 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBA4AP68366 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBA4AP68366 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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