Protein–RNA interactions for Protein: P62995

TRA2B, Transformer-2 protein homolog beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRA2BP62995 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRA2BP62995 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRA2BP62995 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRA2BP62995 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TRA2BP62995 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRA2BP62995 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRA2BP62995 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRA2BP62995 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRA2BP62995 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRA2BP62995 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRA2BP62995 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRA2BP62995 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRA2BP62995 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRA2BP62995 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRA2BP62995 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRA2BP62995 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRA2BP62995 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRA2BP62995 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRA2BP62995 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRA2BP62995 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRA2BP62995 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRA2BP62995 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRA2BP62995 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRA2BP62995 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRA2BP62995 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRA2BP62995 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRA2BP62995 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TRA2BP62995 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TRA2BP62995 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRA2BP62995 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRA2BP62995 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRA2BP62995 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRA2BP62995 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRA2BP62995 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRA2BP62995 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRA2BP62995 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRA2BP62995 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRA2BP62995 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRA2BP62995 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRA2BP62995 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRA2BP62995 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRA2BP62995 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRA2BP62995 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRA2BP62995 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRA2BP62995 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRA2BP62995 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRA2BP62995 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRA2BP62995 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRA2BP62995 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRA2BP62995 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRA2BP62995 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRA2BP62995 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRA2BP62995 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRA2BP62995 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRA2BP62995 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRA2BP62995 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRA2BP62995 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRA2BP62995 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRA2BP62995 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRA2BP62995 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
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TRA2BP62995 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRA2BP62995 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRA2BP62995 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TRA2BP62995 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRA2BP62995 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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TRA2BP62995 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRA2BP62995 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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TRA2BP62995 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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TRA2BP62995 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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TRA2BP62995 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRA2BP62995 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRA2BP62995 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRA2BP62995 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRA2BP62995 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRA2BP62995 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRA2BP62995 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRA2BP62995 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRA2BP62995 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRA2BP62995 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRA2BP62995 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRA2BP62995 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRA2BP62995 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRA2BP62995 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRA2BP62995 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRA2BP62995 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRA2BP62995 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRA2BP62995 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRA2BP62995 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRA2BP62995 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRA2BP62995 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRA2BP62995 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRA2BP62995 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRA2BP62995 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
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