Protein–RNA interactions for Protein: P17482

HOXB9, Homeobox protein Hox-B9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB9P17482 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms