Protein–RNA interactions for Protein: P12074

COX6A1, Cytochrome c oxidase subunit 6A1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX6A1P12074 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COX6A1P12074 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COX6A1P12074 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
COX6A1P12074 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
COX6A1P12074 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COX6A1P12074 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
COX6A1P12074 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COX6A1P12074 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COX6A1P12074 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
COX6A1P12074 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
COX6A1P12074 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COX6A1P12074 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COX6A1P12074 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COX6A1P12074 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COX6A1P12074 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COX6A1P12074 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COX6A1P12074 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
COX6A1P12074 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
COX6A1P12074 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
COX6A1P12074 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
COX6A1P12074 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
COX6A1P12074 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COX6A1P12074 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
COX6A1P12074 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COX6A1P12074 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
COX6A1P12074 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
COX6A1P12074 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
COX6A1P12074 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
COX6A1P12074 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COX6A1P12074 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
COX6A1P12074 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COX6A1P12074 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
COX6A1P12074 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COX6A1P12074 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COX6A1P12074 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
COX6A1P12074 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
COX6A1P12074 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
COX6A1P12074 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COX6A1P12074 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
COX6A1P12074 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
COX6A1P12074 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COX6A1P12074 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COX6A1P12074 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COX6A1P12074 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COX6A1P12074 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
COX6A1P12074 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COX6A1P12074 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COX6A1P12074 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COX6A1P12074 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COX6A1P12074 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COX6A1P12074 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COX6A1P12074 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COX6A1P12074 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COX6A1P12074 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COX6A1P12074 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COX6A1P12074 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COX6A1P12074 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COX6A1P12074 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COX6A1P12074 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COX6A1P12074 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COX6A1P12074 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COX6A1P12074 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COX6A1P12074 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COX6A1P12074 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COX6A1P12074 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COX6A1P12074 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COX6A1P12074 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COX6A1P12074 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COX6A1P12074 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
COX6A1P12074 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COX6A1P12074 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COX6A1P12074 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COX6A1P12074 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COX6A1P12074 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
COX6A1P12074 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COX6A1P12074 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COX6A1P12074 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
COX6A1P12074 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COX6A1P12074 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COX6A1P12074 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COX6A1P12074 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COX6A1P12074 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COX6A1P12074 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COX6A1P12074 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COX6A1P12074 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COX6A1P12074 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COX6A1P12074 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COX6A1P12074 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COX6A1P12074 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COX6A1P12074 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COX6A1P12074 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COX6A1P12074 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
COX6A1P12074 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
COX6A1P12074 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COX6A1P12074 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COX6A1P12074 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COX6A1P12074 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
COX6A1P12074 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COX6A1P12074 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COX6A1P12074 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms