Protein–RNA interactions for Protein: O14967

CLGN, Calmegin, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLGNO14967 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CLGNO14967 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CLGNO14967 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CLGNO14967 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CLGNO14967 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CLGNO14967 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CLGNO14967 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CLGNO14967 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CLGNO14967 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CLGNO14967 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CLGNO14967 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CLGNO14967 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CLGNO14967 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CLGNO14967 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CLGNO14967 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CLGNO14967 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CLGNO14967 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CLGNO14967 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CLGNO14967 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CLGNO14967 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CLGNO14967 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CLGNO14967 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CLGNO14967 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CLGNO14967 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CLGNO14967 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CLGNO14967 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CLGNO14967 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CLGNO14967 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CLGNO14967 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CLGNO14967 MDM1-203ENST00000393543 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CLGNO14967 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CLGNO14967 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CLGNO14967 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CLGNO14967 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CLGNO14967 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CLGNO14967 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CLGNO14967 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CLGNO14967 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CLGNO14967 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CLGNO14967 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CLGNO14967 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CLGNO14967 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CLGNO14967 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CLGNO14967 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CLGNO14967 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CLGNO14967 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CLGNO14967 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CLGNO14967 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CLGNO14967 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CLGNO14967 TMUB2-201ENST00000319511 2418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CLGNO14967 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CLGNO14967 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CLGNO14967 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CLGNO14967 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CLGNO14967 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CLGNO14967 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CLGNO14967 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CLGNO14967 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CLGNO14967 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CLGNO14967 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CLGNO14967 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CLGNO14967 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CLGNO14967 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CLGNO14967 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CLGNO14967 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CLGNO14967 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CLGNO14967 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CLGNO14967 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CLGNO14967 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CLGNO14967 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CLGNO14967 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CLGNO14967 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CLGNO14967 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CLGNO14967 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CLGNO14967 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CLGNO14967 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CLGNO14967 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CLGNO14967 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CLGNO14967 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CLGNO14967 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CLGNO14967 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CLGNO14967 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CLGNO14967 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CLGNO14967 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CLGNO14967 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CLGNO14967 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CLGNO14967 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLGNO14967 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLGNO14967 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLGNO14967 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLGNO14967 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLGNO14967 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLGNO14967 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLGNO14967 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLGNO14967 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLGNO14967 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLGNO14967 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CLGNO14967 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLGNO14967 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLGNO14967 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms