Protein–RNA interactions for Protein: J3QRK9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QRK9 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
J3QRK9 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
J3QRK9 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
J3QRK9 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
J3QRK9 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
J3QRK9 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
J3QRK9 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
J3QRK9 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
J3QRK9 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
J3QRK9 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
J3QRK9 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
J3QRK9 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
J3QRK9 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
J3QRK9 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
J3QRK9 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
J3QRK9 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
J3QRK9 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
J3QRK9 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
J3QRK9 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
J3QRK9 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
J3QRK9 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
J3QRK9 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
J3QRK9 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
J3QRK9 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
J3QRK9 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
J3QRK9 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
J3QRK9 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
J3QRK9 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
J3QRK9 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
J3QRK9 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
J3QRK9 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
J3QRK9 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
J3QRK9 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
J3QRK9 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
J3QRK9 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
J3QRK9 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
J3QRK9 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
J3QRK9 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
J3QRK9 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
J3QRK9 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
J3QRK9 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
J3QRK9 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
J3QRK9 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
J3QRK9 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
J3QRK9 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
J3QRK9 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
J3QRK9 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
J3QRK9 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
J3QRK9 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
J3QRK9 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
J3QRK9 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
J3QRK9 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
J3QRK9 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
J3QRK9 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
J3QRK9 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
J3QRK9 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
J3QRK9 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
J3QRK9 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
J3QRK9 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
J3QRK9 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
J3QRK9 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
J3QRK9 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
J3QRK9 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
J3QRK9 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
J3QRK9 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
J3QRK9 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
J3QRK9 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
J3QRK9 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
J3QRK9 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
J3QRK9 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
J3QRK9 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
J3QRK9 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
J3QRK9 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
J3QRK9 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
J3QRK9 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
J3QRK9 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
J3QRK9 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
J3QRK9 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
J3QRK9 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
J3QRK9 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
J3QRK9 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
J3QRK9 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
J3QRK9 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
J3QRK9 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
J3QRK9 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
J3QRK9 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
J3QRK9 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
J3QRK9 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
J3QRK9 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
J3QRK9 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
J3QRK9 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
J3QRK9 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
J3QRK9 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
J3QRK9 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
J3QRK9 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
J3QRK9 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
J3QRK9 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
J3QRK9 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
J3QRK9 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
J3QRK9 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms