Protein–RNA interactions for Protein: B4E171

Tetraspanin, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4E171 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
B4E171 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
B4E171 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
B4E171 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
B4E171 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
B4E171 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
B4E171 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
B4E171 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
B4E171 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
B4E171 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
B4E171 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
B4E171 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
B4E171 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
B4E171 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
B4E171 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
B4E171 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
B4E171 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
B4E171 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
B4E171 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
B4E171 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
B4E171 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
B4E171 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
B4E171 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
B4E171 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
B4E171 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
B4E171 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
B4E171 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
B4E171 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
B4E171 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
B4E171 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
B4E171 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
B4E171 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
B4E171 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
B4E171 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
B4E171 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
B4E171 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
B4E171 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
B4E171 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
B4E171 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
B4E171 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
B4E171 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
B4E171 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
B4E171 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
B4E171 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
B4E171 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
B4E171 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
B4E171 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
B4E171 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
B4E171 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
B4E171 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
B4E171 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
B4E171 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
B4E171 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
B4E171 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
B4E171 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
B4E171 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
B4E171 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
B4E171 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
B4E171 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
B4E171 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
B4E171 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
B4E171 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
B4E171 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
B4E171 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
B4E171 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
B4E171 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
B4E171 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
B4E171 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
B4E171 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
B4E171 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
B4E171 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
B4E171 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
B4E171 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
B4E171 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
B4E171 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
B4E171 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
B4E171 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
B4E171 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
B4E171 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
B4E171 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
B4E171 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
B4E171 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
B4E171 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
B4E171 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
B4E171 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
B4E171 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
B4E171 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
B4E171 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
B4E171 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
B4E171 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
B4E171 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
B4E171 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
B4E171 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
B4E171 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
B4E171 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
B4E171 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
B4E171 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
B4E171 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
B4E171 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
B4E171 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms