Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PSDA5PKW4 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
PSDA5PKW4 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PSDA5PKW4 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PSDA5PKW4 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PSDA5PKW4 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PSDA5PKW4 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
PSDA5PKW4 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PSDA5PKW4 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PSDA5PKW4 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PSDA5PKW4 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PSDA5PKW4 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PSDA5PKW4 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PSDA5PKW4 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PSDA5PKW4 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PSDA5PKW4 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PSDA5PKW4 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PSDA5PKW4 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PSDA5PKW4 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PSDA5PKW4 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PSDA5PKW4 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PSDA5PKW4 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PSDA5PKW4 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PSDA5PKW4 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PSDA5PKW4 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
PSDA5PKW4 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PSDA5PKW4 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PSDA5PKW4 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PSDA5PKW4 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PSDA5PKW4 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PSDA5PKW4 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PSDA5PKW4 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PSDA5PKW4 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PSDA5PKW4 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PSDA5PKW4 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PSDA5PKW4 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PSDA5PKW4 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PSDA5PKW4 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PSDA5PKW4 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PSDA5PKW4 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PSDA5PKW4 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PSDA5PKW4 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PSDA5PKW4 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PSDA5PKW4 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PSDA5PKW4 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PSDA5PKW4 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PSDA5PKW4 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PSDA5PKW4 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PSDA5PKW4 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PSDA5PKW4 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PSDA5PKW4 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PSDA5PKW4 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PSDA5PKW4 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PSDA5PKW4 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PSDA5PKW4 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PSDA5PKW4 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PSDA5PKW4 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PSDA5PKW4 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PSDA5PKW4 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PSDA5PKW4 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PSDA5PKW4 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PSDA5PKW4 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
PSDA5PKW4 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PSDA5PKW4 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
PSDA5PKW4 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
PSDA5PKW4 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PSDA5PKW4 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PSDA5PKW4 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PSDA5PKW4 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PSDA5PKW4 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PSDA5PKW4 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PSDA5PKW4 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PSDA5PKW4 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PSDA5PKW4 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PSDA5PKW4 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PSDA5PKW4 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PSDA5PKW4 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PSDA5PKW4 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PSDA5PKW4 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PSDA5PKW4 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PSDA5PKW4 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PSDA5PKW4 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PSDA5PKW4 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PSDA5PKW4 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PSDA5PKW4 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PSDA5PKW4 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PSDA5PKW4 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PSDA5PKW4 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PSDA5PKW4 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PSDA5PKW4 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PSDA5PKW4 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PSDA5PKW4 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PSDA5PKW4 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PSDA5PKW4 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PSDA5PKW4 AC116609.2-201ENST00000431542 256 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PSDA5PKW4 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PSDA5PKW4 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PSDA5PKW4 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
PSDA5PKW4 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PSDA5PKW4 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms