Protein–RNA interactions for Protein: A4D0V7

CPED1, Cadherin-like and PC-esterase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPED1A4D0V7 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CPED1A4D0V7 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CPED1A4D0V7 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CPED1A4D0V7 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CPED1A4D0V7 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CPED1A4D0V7 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CPED1A4D0V7 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CPED1A4D0V7 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CPED1A4D0V7 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CPED1A4D0V7 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CPED1A4D0V7 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CPED1A4D0V7 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CPED1A4D0V7 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CPED1A4D0V7 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CPED1A4D0V7 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CPED1A4D0V7 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CPED1A4D0V7 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CPED1A4D0V7 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CPED1A4D0V7 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CPED1A4D0V7 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CPED1A4D0V7 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CPED1A4D0V7 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CPED1A4D0V7 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CPED1A4D0V7 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CPED1A4D0V7 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CPED1A4D0V7 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CPED1A4D0V7 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CPED1A4D0V7 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CPED1A4D0V7 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CPED1A4D0V7 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CPED1A4D0V7 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CPED1A4D0V7 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CPED1A4D0V7 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CPED1A4D0V7 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CPED1A4D0V7 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CPED1A4D0V7 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CPED1A4D0V7 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CPED1A4D0V7 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CPED1A4D0V7 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CPED1A4D0V7 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CPED1A4D0V7 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CPED1A4D0V7 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CPED1A4D0V7 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CPED1A4D0V7 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CPED1A4D0V7 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CPED1A4D0V7 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CPED1A4D0V7 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CPED1A4D0V7 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CPED1A4D0V7 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CPED1A4D0V7 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CPED1A4D0V7 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CPED1A4D0V7 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CPED1A4D0V7 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CPED1A4D0V7 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CPED1A4D0V7 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CPED1A4D0V7 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CPED1A4D0V7 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CPED1A4D0V7 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CPED1A4D0V7 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CPED1A4D0V7 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CPED1A4D0V7 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CPED1A4D0V7 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CPED1A4D0V7 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CPED1A4D0V7 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CPED1A4D0V7 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CPED1A4D0V7 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CPED1A4D0V7 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CPED1A4D0V7 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CPED1A4D0V7 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CPED1A4D0V7 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CPED1A4D0V7 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CPED1A4D0V7 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CPED1A4D0V7 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CPED1A4D0V7 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CPED1A4D0V7 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CPED1A4D0V7 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CPED1A4D0V7 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CPED1A4D0V7 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CPED1A4D0V7 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CPED1A4D0V7 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CPED1A4D0V7 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CPED1A4D0V7 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CPED1A4D0V7 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CPED1A4D0V7 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CPED1A4D0V7 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CPED1A4D0V7 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CPED1A4D0V7 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CPED1A4D0V7 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CPED1A4D0V7 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CPED1A4D0V7 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CPED1A4D0V7 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CPED1A4D0V7 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CPED1A4D0V7 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CPED1A4D0V7 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CPED1A4D0V7 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CPED1A4D0V7 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CPED1A4D0V7 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CPED1A4D0V7 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CPED1A4D0V7 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CPED1A4D0V7 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms