Protein–RNA interactions for Protein: A0AVI4

TMEM129, E3 ubiquitin-protein ligase TM129, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM129A0AVI4 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM129A0AVI4 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM129A0AVI4 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM129A0AVI4 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM129A0AVI4 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM129A0AVI4 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM129A0AVI4 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM129A0AVI4 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM129A0AVI4 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM129A0AVI4 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM129A0AVI4 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM129A0AVI4 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM129A0AVI4 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM129A0AVI4 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM129A0AVI4 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM129A0AVI4 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM129A0AVI4 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM129A0AVI4 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM129A0AVI4 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM129A0AVI4 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM129A0AVI4 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM129A0AVI4 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TMEM129A0AVI4 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM129A0AVI4 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM129A0AVI4 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM129A0AVI4 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM129A0AVI4 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TMEM129A0AVI4 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TMEM129A0AVI4 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM129A0AVI4 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM129A0AVI4 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM129A0AVI4 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM129A0AVI4 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM129A0AVI4 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TMEM129A0AVI4 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TMEM129A0AVI4 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TMEM129A0AVI4 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM129A0AVI4 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM129A0AVI4 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM129A0AVI4 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM129A0AVI4 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM129A0AVI4 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM129A0AVI4 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM129A0AVI4 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM129A0AVI4 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM129A0AVI4 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM129A0AVI4 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM129A0AVI4 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM129A0AVI4 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TMEM129A0AVI4 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM129A0AVI4 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TMEM129A0AVI4 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM129A0AVI4 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM129A0AVI4 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM129A0AVI4 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM129A0AVI4 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM129A0AVI4 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM129A0AVI4 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM129A0AVI4 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM129A0AVI4 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TMEM129A0AVI4 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM129A0AVI4 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM129A0AVI4 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM129A0AVI4 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TMEM129A0AVI4 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM129A0AVI4 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM129A0AVI4 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM129A0AVI4 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM129A0AVI4 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TMEM129A0AVI4 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM129A0AVI4 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM129A0AVI4 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM129A0AVI4 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TMEM129A0AVI4 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TMEM129A0AVI4 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TMEM129A0AVI4 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM129A0AVI4 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM129A0AVI4 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM129A0AVI4 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM129A0AVI4 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM129A0AVI4 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM129A0AVI4 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM129A0AVI4 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM129A0AVI4 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM129A0AVI4 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM129A0AVI4 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TMEM129A0AVI4 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM129A0AVI4 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM129A0AVI4 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM129A0AVI4 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TMEM129A0AVI4 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TMEM129A0AVI4 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TMEM129A0AVI4 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TMEM129A0AVI4 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.02■□□□□ -0
TMEM129A0AVI4 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TMEM129A0AVI4 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TMEM129A0AVI4 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.02■□□□□ -0
TMEM129A0AVI4 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TMEM129A0AVI4 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TMEM129A0AVI4 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms