Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R4

MAP3K4, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K4Q9Y6R4 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MAP3K4Q9Y6R4 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MAP3K4Q9Y6R4 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
MAP3K4Q9Y6R4 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MAP3K4Q9Y6R4 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MAP3K4Q9Y6R4 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MAP3K4Q9Y6R4 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MAP3K4Q9Y6R4 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MAP3K4Q9Y6R4 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MAP3K4Q9Y6R4 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MAP3K4Q9Y6R4 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MAP3K4Q9Y6R4 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MAP3K4Q9Y6R4 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MAP3K4Q9Y6R4 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MAP3K4Q9Y6R4 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MAP3K4Q9Y6R4 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MAP3K4Q9Y6R4 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MAP3K4Q9Y6R4 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MAP3K4Q9Y6R4 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MAP3K4Q9Y6R4 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MAP3K4Q9Y6R4 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
MAP3K4Q9Y6R4 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MAP3K4Q9Y6R4 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MAP3K4Q9Y6R4 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MAP3K4Q9Y6R4 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MAP3K4Q9Y6R4 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MAP3K4Q9Y6R4 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
MAP3K4Q9Y6R4 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MAP3K4Q9Y6R4 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MAP3K4Q9Y6R4 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
MAP3K4Q9Y6R4 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MAP3K4Q9Y6R4 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MAP3K4Q9Y6R4 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MAP3K4Q9Y6R4 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MAP3K4Q9Y6R4 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
MAP3K4Q9Y6R4 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MAP3K4Q9Y6R4 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MAP3K4Q9Y6R4 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MAP3K4Q9Y6R4 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MAP3K4Q9Y6R4 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MAP3K4Q9Y6R4 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MAP3K4Q9Y6R4 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MAP3K4Q9Y6R4 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MAP3K4Q9Y6R4 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MAP3K4Q9Y6R4 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MAP3K4Q9Y6R4 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MAP3K4Q9Y6R4 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
MAP3K4Q9Y6R4 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MAP3K4Q9Y6R4 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MAP3K4Q9Y6R4 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MAP3K4Q9Y6R4 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MAP3K4Q9Y6R4 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
MAP3K4Q9Y6R4 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MAP3K4Q9Y6R4 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
MAP3K4Q9Y6R4 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MAP3K4Q9Y6R4 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
MAP3K4Q9Y6R4 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
MAP3K4Q9Y6R4 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
MAP3K4Q9Y6R4 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
MAP3K4Q9Y6R4 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
MAP3K4Q9Y6R4 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
MAP3K4Q9Y6R4 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MAP3K4Q9Y6R4 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MAP3K4Q9Y6R4 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MAP3K4Q9Y6R4 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MAP3K4Q9Y6R4 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MAP3K4Q9Y6R4 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MAP3K4Q9Y6R4 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MAP3K4Q9Y6R4 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MAP3K4Q9Y6R4 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MAP3K4Q9Y6R4 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MAP3K4Q9Y6R4 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MAP3K4Q9Y6R4 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MAP3K4Q9Y6R4 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MAP3K4Q9Y6R4 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MAP3K4Q9Y6R4 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MAP3K4Q9Y6R4 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MAP3K4Q9Y6R4 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MAP3K4Q9Y6R4 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MAP3K4Q9Y6R4 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MAP3K4Q9Y6R4 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MAP3K4Q9Y6R4 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MAP3K4Q9Y6R4 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MAP3K4Q9Y6R4 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MAP3K4Q9Y6R4 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MAP3K4Q9Y6R4 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MAP3K4Q9Y6R4 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MAP3K4Q9Y6R4 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MAP3K4Q9Y6R4 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MAP3K4Q9Y6R4 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MAP3K4Q9Y6R4 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MAP3K4Q9Y6R4 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
MAP3K4Q9Y6R4 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MAP3K4Q9Y6R4 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MAP3K4Q9Y6R4 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
MAP3K4Q9Y6R4 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MAP3K4Q9Y6R4 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms