Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4W6

AFG3L2, AFG3-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFG3L2Q9Y4W6 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
AFG3L2Q9Y4W6 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
AFG3L2Q9Y4W6 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
AFG3L2Q9Y4W6 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
AFG3L2Q9Y4W6 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
AFG3L2Q9Y4W6 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
AFG3L2Q9Y4W6 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
AFG3L2Q9Y4W6 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
AFG3L2Q9Y4W6 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
AFG3L2Q9Y4W6 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
AFG3L2Q9Y4W6 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
AFG3L2Q9Y4W6 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
AFG3L2Q9Y4W6 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
AFG3L2Q9Y4W6 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
AFG3L2Q9Y4W6 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
AFG3L2Q9Y4W6 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
AFG3L2Q9Y4W6 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
AFG3L2Q9Y4W6 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
AFG3L2Q9Y4W6 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
AFG3L2Q9Y4W6 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
AFG3L2Q9Y4W6 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
AFG3L2Q9Y4W6 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
AFG3L2Q9Y4W6 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
AFG3L2Q9Y4W6 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
AFG3L2Q9Y4W6 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
AFG3L2Q9Y4W6 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
AFG3L2Q9Y4W6 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
AFG3L2Q9Y4W6 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
AFG3L2Q9Y4W6 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
AFG3L2Q9Y4W6 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
AFG3L2Q9Y4W6 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
AFG3L2Q9Y4W6 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
AFG3L2Q9Y4W6 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
AFG3L2Q9Y4W6 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
AFG3L2Q9Y4W6 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
AFG3L2Q9Y4W6 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
AFG3L2Q9Y4W6 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
AFG3L2Q9Y4W6 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
AFG3L2Q9Y4W6 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
AFG3L2Q9Y4W6 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
AFG3L2Q9Y4W6 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
AFG3L2Q9Y4W6 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
AFG3L2Q9Y4W6 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
AFG3L2Q9Y4W6 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
AFG3L2Q9Y4W6 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
AFG3L2Q9Y4W6 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
AFG3L2Q9Y4W6 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
AFG3L2Q9Y4W6 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
AFG3L2Q9Y4W6 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
AFG3L2Q9Y4W6 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
AFG3L2Q9Y4W6 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
AFG3L2Q9Y4W6 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
AFG3L2Q9Y4W6 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
AFG3L2Q9Y4W6 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
AFG3L2Q9Y4W6 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
AFG3L2Q9Y4W6 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
AFG3L2Q9Y4W6 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
AFG3L2Q9Y4W6 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
AFG3L2Q9Y4W6 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
AFG3L2Q9Y4W6 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
AFG3L2Q9Y4W6 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
AFG3L2Q9Y4W6 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
AFG3L2Q9Y4W6 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
AFG3L2Q9Y4W6 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
AFG3L2Q9Y4W6 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
AFG3L2Q9Y4W6 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
AFG3L2Q9Y4W6 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
AFG3L2Q9Y4W6 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
AFG3L2Q9Y4W6 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
AFG3L2Q9Y4W6 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
AFG3L2Q9Y4W6 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
AFG3L2Q9Y4W6 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
AFG3L2Q9Y4W6 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
AFG3L2Q9Y4W6 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
AFG3L2Q9Y4W6 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
AFG3L2Q9Y4W6 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
AFG3L2Q9Y4W6 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
AFG3L2Q9Y4W6 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
AFG3L2Q9Y4W6 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
AFG3L2Q9Y4W6 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
AFG3L2Q9Y4W6 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
AFG3L2Q9Y4W6 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
AFG3L2Q9Y4W6 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
AFG3L2Q9Y4W6 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
AFG3L2Q9Y4W6 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
AFG3L2Q9Y4W6 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
AFG3L2Q9Y4W6 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
AFG3L2Q9Y4W6 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
AFG3L2Q9Y4W6 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
AFG3L2Q9Y4W6 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
AFG3L2Q9Y4W6 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
AFG3L2Q9Y4W6 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
AFG3L2Q9Y4W6 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
AFG3L2Q9Y4W6 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
AFG3L2Q9Y4W6 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
AFG3L2Q9Y4W6 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
AFG3L2Q9Y4W6 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
AFG3L2Q9Y4W6 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
AFG3L2Q9Y4W6 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
AFG3L2Q9Y4W6 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms