Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRAPPC8Q9Y2L5 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRAPPC8Q9Y2L5 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRAPPC8Q9Y2L5 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRAPPC8Q9Y2L5 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TRAPPC8Q9Y2L5 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TRAPPC8Q9Y2L5 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRAPPC8Q9Y2L5 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRAPPC8Q9Y2L5 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRAPPC8Q9Y2L5 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRAPPC8Q9Y2L5 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRAPPC8Q9Y2L5 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRAPPC8Q9Y2L5 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRAPPC8Q9Y2L5 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRAPPC8Q9Y2L5 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TRAPPC8Q9Y2L5 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRAPPC8Q9Y2L5 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRAPPC8Q9Y2L5 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TRAPPC8Q9Y2L5 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRAPPC8Q9Y2L5 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRAPPC8Q9Y2L5 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TRAPPC8Q9Y2L5 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRAPPC8Q9Y2L5 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRAPPC8Q9Y2L5 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRAPPC8Q9Y2L5 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRAPPC8Q9Y2L5 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRAPPC8Q9Y2L5 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRAPPC8Q9Y2L5 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRAPPC8Q9Y2L5 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRAPPC8Q9Y2L5 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRAPPC8Q9Y2L5 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TRAPPC8Q9Y2L5 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRAPPC8Q9Y2L5 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRAPPC8Q9Y2L5 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRAPPC8Q9Y2L5 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRAPPC8Q9Y2L5 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRAPPC8Q9Y2L5 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRAPPC8Q9Y2L5 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRAPPC8Q9Y2L5 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRAPPC8Q9Y2L5 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRAPPC8Q9Y2L5 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRAPPC8Q9Y2L5 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRAPPC8Q9Y2L5 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TRAPPC8Q9Y2L5 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TRAPPC8Q9Y2L5 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRAPPC8Q9Y2L5 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TRAPPC8Q9Y2L5 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRAPPC8Q9Y2L5 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TRAPPC8Q9Y2L5 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TRAPPC8Q9Y2L5 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRAPPC8Q9Y2L5 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRAPPC8Q9Y2L5 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRAPPC8Q9Y2L5 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRAPPC8Q9Y2L5 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRAPPC8Q9Y2L5 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRAPPC8Q9Y2L5 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRAPPC8Q9Y2L5 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRAPPC8Q9Y2L5 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRAPPC8Q9Y2L5 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRAPPC8Q9Y2L5 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TRAPPC8Q9Y2L5 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRAPPC8Q9Y2L5 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRAPPC8Q9Y2L5 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRAPPC8Q9Y2L5 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRAPPC8Q9Y2L5 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRAPPC8Q9Y2L5 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRAPPC8Q9Y2L5 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRAPPC8Q9Y2L5 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TRAPPC8Q9Y2L5 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRAPPC8Q9Y2L5 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TRAPPC8Q9Y2L5 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRAPPC8Q9Y2L5 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRAPPC8Q9Y2L5 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRAPPC8Q9Y2L5 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRAPPC8Q9Y2L5 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRAPPC8Q9Y2L5 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRAPPC8Q9Y2L5 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRAPPC8Q9Y2L5 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRAPPC8Q9Y2L5 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRAPPC8Q9Y2L5 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRAPPC8Q9Y2L5 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRAPPC8Q9Y2L5 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRAPPC8Q9Y2L5 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRAPPC8Q9Y2L5 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRAPPC8Q9Y2L5 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRAPPC8Q9Y2L5 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRAPPC8Q9Y2L5 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRAPPC8Q9Y2L5 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRAPPC8Q9Y2L5 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRAPPC8Q9Y2L5 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TRAPPC8Q9Y2L5 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRAPPC8Q9Y2L5 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms