Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX8

SHANK2, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2Q9UPX8 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SHANK2Q9UPX8 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SHANK2Q9UPX8 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SHANK2Q9UPX8 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SHANK2Q9UPX8 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SHANK2Q9UPX8 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SHANK2Q9UPX8 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SHANK2Q9UPX8 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SHANK2Q9UPX8 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SHANK2Q9UPX8 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SHANK2Q9UPX8 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SHANK2Q9UPX8 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SHANK2Q9UPX8 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SHANK2Q9UPX8 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SHANK2Q9UPX8 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SHANK2Q9UPX8 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SHANK2Q9UPX8 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SHANK2Q9UPX8 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SHANK2Q9UPX8 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SHANK2Q9UPX8 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SHANK2Q9UPX8 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SHANK2Q9UPX8 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SHANK2Q9UPX8 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SHANK2Q9UPX8 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SHANK2Q9UPX8 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SHANK2Q9UPX8 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SHANK2Q9UPX8 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SHANK2Q9UPX8 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SHANK2Q9UPX8 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SHANK2Q9UPX8 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SHANK2Q9UPX8 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SHANK2Q9UPX8 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SHANK2Q9UPX8 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SHANK2Q9UPX8 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SHANK2Q9UPX8 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SHANK2Q9UPX8 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SHANK2Q9UPX8 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SHANK2Q9UPX8 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SHANK2Q9UPX8 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SHANK2Q9UPX8 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SHANK2Q9UPX8 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SHANK2Q9UPX8 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SHANK2Q9UPX8 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SHANK2Q9UPX8 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SHANK2Q9UPX8 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SHANK2Q9UPX8 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SHANK2Q9UPX8 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SHANK2Q9UPX8 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SHANK2Q9UPX8 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SHANK2Q9UPX8 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SHANK2Q9UPX8 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SHANK2Q9UPX8 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SHANK2Q9UPX8 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SHANK2Q9UPX8 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SHANK2Q9UPX8 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SHANK2Q9UPX8 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SHANK2Q9UPX8 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SHANK2Q9UPX8 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SHANK2Q9UPX8 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SHANK2Q9UPX8 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SHANK2Q9UPX8 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SHANK2Q9UPX8 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SHANK2Q9UPX8 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SHANK2Q9UPX8 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SHANK2Q9UPX8 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SHANK2Q9UPX8 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SHANK2Q9UPX8 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SHANK2Q9UPX8 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SHANK2Q9UPX8 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SHANK2Q9UPX8 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SHANK2Q9UPX8 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SHANK2Q9UPX8 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SHANK2Q9UPX8 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SHANK2Q9UPX8 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SHANK2Q9UPX8 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SHANK2Q9UPX8 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SHANK2Q9UPX8 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SHANK2Q9UPX8 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SHANK2Q9UPX8 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SHANK2Q9UPX8 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SHANK2Q9UPX8 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SHANK2Q9UPX8 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SHANK2Q9UPX8 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SHANK2Q9UPX8 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SHANK2Q9UPX8 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SHANK2Q9UPX8 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SHANK2Q9UPX8 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SHANK2Q9UPX8 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SHANK2Q9UPX8 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SHANK2Q9UPX8 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SHANK2Q9UPX8 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SHANK2Q9UPX8 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SHANK2Q9UPX8 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SHANK2Q9UPX8 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SHANK2Q9UPX8 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SHANK2Q9UPX8 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
SHANK2Q9UPX8 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SHANK2Q9UPX8 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SHANK2Q9UPX8 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SHANK2Q9UPX8 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms