Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH7

SNX6, Sorting nexin-6, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX6Q9UNH7 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX6Q9UNH7 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX6Q9UNH7 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX6Q9UNH7 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX6Q9UNH7 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX6Q9UNH7 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX6Q9UNH7 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX6Q9UNH7 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX6Q9UNH7 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX6Q9UNH7 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX6Q9UNH7 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX6Q9UNH7 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX6Q9UNH7 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX6Q9UNH7 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX6Q9UNH7 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX6Q9UNH7 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX6Q9UNH7 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX6Q9UNH7 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX6Q9UNH7 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX6Q9UNH7 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX6Q9UNH7 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX6Q9UNH7 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX6Q9UNH7 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX6Q9UNH7 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX6Q9UNH7 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX6Q9UNH7 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX6Q9UNH7 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX6Q9UNH7 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX6Q9UNH7 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX6Q9UNH7 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX6Q9UNH7 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX6Q9UNH7 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX6Q9UNH7 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX6Q9UNH7 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX6Q9UNH7 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX6Q9UNH7 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX6Q9UNH7 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX6Q9UNH7 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX6Q9UNH7 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX6Q9UNH7 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX6Q9UNH7 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX6Q9UNH7 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX6Q9UNH7 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX6Q9UNH7 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX6Q9UNH7 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX6Q9UNH7 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX6Q9UNH7 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX6Q9UNH7 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX6Q9UNH7 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX6Q9UNH7 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX6Q9UNH7 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX6Q9UNH7 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX6Q9UNH7 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX6Q9UNH7 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX6Q9UNH7 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX6Q9UNH7 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX6Q9UNH7 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX6Q9UNH7 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX6Q9UNH7 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX6Q9UNH7 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX6Q9UNH7 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX6Q9UNH7 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX6Q9UNH7 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX6Q9UNH7 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX6Q9UNH7 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX6Q9UNH7 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX6Q9UNH7 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX6Q9UNH7 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SNX6Q9UNH7 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SNX6Q9UNH7 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SNX6Q9UNH7 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SNX6Q9UNH7 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SNX6Q9UNH7 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
SNX6Q9UNH7 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SNX6Q9UNH7 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SNX6Q9UNH7 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
SNX6Q9UNH7 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SNX6Q9UNH7 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SNX6Q9UNH7 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX6Q9UNH7 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX6Q9UNH7 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX6Q9UNH7 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX6Q9UNH7 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX6Q9UNH7 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX6Q9UNH7 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX6Q9UNH7 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX6Q9UNH7 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX6Q9UNH7 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX6Q9UNH7 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX6Q9UNH7 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX6Q9UNH7 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX6Q9UNH7 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX6Q9UNH7 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX6Q9UNH7 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX6Q9UNH7 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX6Q9UNH7 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX6Q9UNH7 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX6Q9UNH7 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX6Q9UNH7 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX6Q9UNH7 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms