Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K6

KLHL42, Kelch-like protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL42Q9P2K6 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms