Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2A4

ABI3, ABI gene family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABI3Q9P2A4 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ABI3Q9P2A4 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ABI3Q9P2A4 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ABI3Q9P2A4 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ABI3Q9P2A4 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ABI3Q9P2A4 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ABI3Q9P2A4 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ABI3Q9P2A4 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ABI3Q9P2A4 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ABI3Q9P2A4 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ABI3Q9P2A4 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ABI3Q9P2A4 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ABI3Q9P2A4 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ABI3Q9P2A4 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ABI3Q9P2A4 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ABI3Q9P2A4 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ABI3Q9P2A4 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ABI3Q9P2A4 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ABI3Q9P2A4 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ABI3Q9P2A4 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ABI3Q9P2A4 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ABI3Q9P2A4 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ABI3Q9P2A4 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ABI3Q9P2A4 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ABI3Q9P2A4 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ABI3Q9P2A4 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ABI3Q9P2A4 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ABI3Q9P2A4 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ABI3Q9P2A4 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ABI3Q9P2A4 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ABI3Q9P2A4 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ABI3Q9P2A4 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ABI3Q9P2A4 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ABI3Q9P2A4 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ABI3Q9P2A4 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ABI3Q9P2A4 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ABI3Q9P2A4 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ABI3Q9P2A4 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ABI3Q9P2A4 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ABI3Q9P2A4 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ABI3Q9P2A4 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ABI3Q9P2A4 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ABI3Q9P2A4 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ABI3Q9P2A4 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ABI3Q9P2A4 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ABI3Q9P2A4 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ABI3Q9P2A4 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ABI3Q9P2A4 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ABI3Q9P2A4 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ABI3Q9P2A4 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ABI3Q9P2A4 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ABI3Q9P2A4 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ABI3Q9P2A4 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ABI3Q9P2A4 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ABI3Q9P2A4 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ABI3Q9P2A4 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ABI3Q9P2A4 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ABI3Q9P2A4 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ABI3Q9P2A4 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ABI3Q9P2A4 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ABI3Q9P2A4 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ABI3Q9P2A4 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ABI3Q9P2A4 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ABI3Q9P2A4 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ABI3Q9P2A4 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ABI3Q9P2A4 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ABI3Q9P2A4 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ABI3Q9P2A4 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ABI3Q9P2A4 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ABI3Q9P2A4 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ABI3Q9P2A4 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ABI3Q9P2A4 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ABI3Q9P2A4 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ABI3Q9P2A4 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ABI3Q9P2A4 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ABI3Q9P2A4 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ABI3Q9P2A4 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ABI3Q9P2A4 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ABI3Q9P2A4 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ABI3Q9P2A4 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ABI3Q9P2A4 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ABI3Q9P2A4 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ABI3Q9P2A4 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ABI3Q9P2A4 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ABI3Q9P2A4 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ABI3Q9P2A4 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ABI3Q9P2A4 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ABI3Q9P2A4 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ABI3Q9P2A4 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ABI3Q9P2A4 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ABI3Q9P2A4 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ABI3Q9P2A4 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ABI3Q9P2A4 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ABI3Q9P2A4 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ABI3Q9P2A4 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ABI3Q9P2A4 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ABI3Q9P2A4 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ABI3Q9P2A4 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ABI3Q9P2A4 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ABI3Q9P2A4 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms