Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ33

ASCL3, Achaete-scute homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL3Q9NQ33 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms