Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW83

IFT27, Intraflagellar transport protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT27Q9BW83 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms