Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTX7

CATSPER4, Cation channel sperm-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CATSPER4Q7RTX7 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CATSPER4Q7RTX7 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CATSPER4Q7RTX7 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CATSPER4Q7RTX7 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CATSPER4Q7RTX7 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CATSPER4Q7RTX7 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CATSPER4Q7RTX7 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CATSPER4Q7RTX7 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CATSPER4Q7RTX7 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CATSPER4Q7RTX7 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CATSPER4Q7RTX7 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CATSPER4Q7RTX7 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CATSPER4Q7RTX7 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CATSPER4Q7RTX7 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CATSPER4Q7RTX7 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CATSPER4Q7RTX7 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CATSPER4Q7RTX7 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CATSPER4Q7RTX7 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CATSPER4Q7RTX7 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CATSPER4Q7RTX7 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CATSPER4Q7RTX7 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CATSPER4Q7RTX7 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CATSPER4Q7RTX7 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CATSPER4Q7RTX7 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CATSPER4Q7RTX7 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CATSPER4Q7RTX7 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CATSPER4Q7RTX7 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CATSPER4Q7RTX7 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CATSPER4Q7RTX7 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CATSPER4Q7RTX7 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CATSPER4Q7RTX7 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CATSPER4Q7RTX7 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CATSPER4Q7RTX7 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CATSPER4Q7RTX7 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CATSPER4Q7RTX7 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CATSPER4Q7RTX7 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CATSPER4Q7RTX7 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CATSPER4Q7RTX7 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CATSPER4Q7RTX7 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CATSPER4Q7RTX7 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CATSPER4Q7RTX7 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CATSPER4Q7RTX7 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CATSPER4Q7RTX7 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CATSPER4Q7RTX7 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CATSPER4Q7RTX7 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CATSPER4Q7RTX7 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CATSPER4Q7RTX7 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CATSPER4Q7RTX7 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CATSPER4Q7RTX7 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CATSPER4Q7RTX7 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CATSPER4Q7RTX7 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CATSPER4Q7RTX7 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CATSPER4Q7RTX7 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CATSPER4Q7RTX7 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CATSPER4Q7RTX7 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CATSPER4Q7RTX7 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CATSPER4Q7RTX7 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CATSPER4Q7RTX7 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CATSPER4Q7RTX7 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CATSPER4Q7RTX7 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CATSPER4Q7RTX7 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CATSPER4Q7RTX7 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CATSPER4Q7RTX7 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CATSPER4Q7RTX7 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CATSPER4Q7RTX7 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CATSPER4Q7RTX7 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CATSPER4Q7RTX7 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CATSPER4Q7RTX7 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CATSPER4Q7RTX7 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CATSPER4Q7RTX7 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CATSPER4Q7RTX7 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CATSPER4Q7RTX7 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CATSPER4Q7RTX7 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
CATSPER4Q7RTX7 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CATSPER4Q7RTX7 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CATSPER4Q7RTX7 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CATSPER4Q7RTX7 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CATSPER4Q7RTX7 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CATSPER4Q7RTX7 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CATSPER4Q7RTX7 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CATSPER4Q7RTX7 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CATSPER4Q7RTX7 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CATSPER4Q7RTX7 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CATSPER4Q7RTX7 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CATSPER4Q7RTX7 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CATSPER4Q7RTX7 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CATSPER4Q7RTX7 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CATSPER4Q7RTX7 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CATSPER4Q7RTX7 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CATSPER4Q7RTX7 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CATSPER4Q7RTX7 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CATSPER4Q7RTX7 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CATSPER4Q7RTX7 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CATSPER4Q7RTX7 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CATSPER4Q7RTX7 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CATSPER4Q7RTX7 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CATSPER4Q7RTX7 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CATSPER4Q7RTX7 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CATSPER4Q7RTX7 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CATSPER4Q7RTX7 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms