Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPU0

CENPP, Centromere protein P, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPPQ6IPU0 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CENPPQ6IPU0 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CENPPQ6IPU0 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CENPPQ6IPU0 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CENPPQ6IPU0 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CENPPQ6IPU0 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CENPPQ6IPU0 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CENPPQ6IPU0 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CENPPQ6IPU0 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CENPPQ6IPU0 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CENPPQ6IPU0 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CENPPQ6IPU0 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CENPPQ6IPU0 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CENPPQ6IPU0 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CENPPQ6IPU0 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CENPPQ6IPU0 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CENPPQ6IPU0 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CENPPQ6IPU0 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CENPPQ6IPU0 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CENPPQ6IPU0 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CENPPQ6IPU0 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CENPPQ6IPU0 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CENPPQ6IPU0 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CENPPQ6IPU0 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CENPPQ6IPU0 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CENPPQ6IPU0 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CENPPQ6IPU0 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CENPPQ6IPU0 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CENPPQ6IPU0 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CENPPQ6IPU0 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CENPPQ6IPU0 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CENPPQ6IPU0 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CENPPQ6IPU0 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CENPPQ6IPU0 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CENPPQ6IPU0 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CENPPQ6IPU0 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CENPPQ6IPU0 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CENPPQ6IPU0 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CENPPQ6IPU0 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CENPPQ6IPU0 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CENPPQ6IPU0 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CENPPQ6IPU0 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CENPPQ6IPU0 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CENPPQ6IPU0 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CENPPQ6IPU0 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CENPPQ6IPU0 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CENPPQ6IPU0 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CENPPQ6IPU0 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CENPPQ6IPU0 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CENPPQ6IPU0 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CENPPQ6IPU0 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CENPPQ6IPU0 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CENPPQ6IPU0 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CENPPQ6IPU0 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CENPPQ6IPU0 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CENPPQ6IPU0 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CENPPQ6IPU0 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CENPPQ6IPU0 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CENPPQ6IPU0 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CENPPQ6IPU0 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CENPPQ6IPU0 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CENPPQ6IPU0 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CENPPQ6IPU0 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CENPPQ6IPU0 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CENPPQ6IPU0 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CENPPQ6IPU0 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CENPPQ6IPU0 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CENPPQ6IPU0 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CENPPQ6IPU0 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CENPPQ6IPU0 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CENPPQ6IPU0 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CENPPQ6IPU0 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CENPPQ6IPU0 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CENPPQ6IPU0 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CENPPQ6IPU0 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CENPPQ6IPU0 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CENPPQ6IPU0 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CENPPQ6IPU0 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CENPPQ6IPU0 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CENPPQ6IPU0 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CENPPQ6IPU0 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CENPPQ6IPU0 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CENPPQ6IPU0 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CENPPQ6IPU0 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CENPPQ6IPU0 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CENPPQ6IPU0 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CENPPQ6IPU0 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CENPPQ6IPU0 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CENPPQ6IPU0 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CENPPQ6IPU0 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CENPPQ6IPU0 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CENPPQ6IPU0 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CENPPQ6IPU0 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CENPPQ6IPU0 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CENPPQ6IPU0 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CENPPQ6IPU0 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CENPPQ6IPU0 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CENPPQ6IPU0 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CENPPQ6IPU0 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CENPPQ6IPU0 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms