Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE7

PHYHD1, Phytanoyl-CoA dioxygenase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHYHD1Q5SRE7 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PHYHD1Q5SRE7 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PHYHD1Q5SRE7 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PHYHD1Q5SRE7 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PHYHD1Q5SRE7 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PHYHD1Q5SRE7 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PHYHD1Q5SRE7 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PHYHD1Q5SRE7 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PHYHD1Q5SRE7 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PHYHD1Q5SRE7 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PHYHD1Q5SRE7 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PHYHD1Q5SRE7 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PHYHD1Q5SRE7 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PHYHD1Q5SRE7 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PHYHD1Q5SRE7 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PHYHD1Q5SRE7 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PHYHD1Q5SRE7 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PHYHD1Q5SRE7 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PHYHD1Q5SRE7 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PHYHD1Q5SRE7 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PHYHD1Q5SRE7 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PHYHD1Q5SRE7 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PHYHD1Q5SRE7 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PHYHD1Q5SRE7 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PHYHD1Q5SRE7 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PHYHD1Q5SRE7 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PHYHD1Q5SRE7 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PHYHD1Q5SRE7 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PHYHD1Q5SRE7 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PHYHD1Q5SRE7 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PHYHD1Q5SRE7 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PHYHD1Q5SRE7 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PHYHD1Q5SRE7 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PHYHD1Q5SRE7 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PHYHD1Q5SRE7 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PHYHD1Q5SRE7 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PHYHD1Q5SRE7 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PHYHD1Q5SRE7 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PHYHD1Q5SRE7 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PHYHD1Q5SRE7 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PHYHD1Q5SRE7 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PHYHD1Q5SRE7 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
PHYHD1Q5SRE7 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
PHYHD1Q5SRE7 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
PHYHD1Q5SRE7 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PHYHD1Q5SRE7 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PHYHD1Q5SRE7 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PHYHD1Q5SRE7 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PHYHD1Q5SRE7 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PHYHD1Q5SRE7 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PHYHD1Q5SRE7 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PHYHD1Q5SRE7 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PHYHD1Q5SRE7 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PHYHD1Q5SRE7 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PHYHD1Q5SRE7 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PHYHD1Q5SRE7 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PHYHD1Q5SRE7 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PHYHD1Q5SRE7 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PHYHD1Q5SRE7 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PHYHD1Q5SRE7 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PHYHD1Q5SRE7 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PHYHD1Q5SRE7 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PHYHD1Q5SRE7 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PHYHD1Q5SRE7 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PHYHD1Q5SRE7 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PHYHD1Q5SRE7 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PHYHD1Q5SRE7 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PHYHD1Q5SRE7 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PHYHD1Q5SRE7 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PHYHD1Q5SRE7 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PHYHD1Q5SRE7 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PHYHD1Q5SRE7 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PHYHD1Q5SRE7 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PHYHD1Q5SRE7 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PHYHD1Q5SRE7 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PHYHD1Q5SRE7 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PHYHD1Q5SRE7 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PHYHD1Q5SRE7 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PHYHD1Q5SRE7 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PHYHD1Q5SRE7 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PHYHD1Q5SRE7 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PHYHD1Q5SRE7 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PHYHD1Q5SRE7 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PHYHD1Q5SRE7 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PHYHD1Q5SRE7 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PHYHD1Q5SRE7 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PHYHD1Q5SRE7 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PHYHD1Q5SRE7 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PHYHD1Q5SRE7 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PHYHD1Q5SRE7 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PHYHD1Q5SRE7 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PHYHD1Q5SRE7 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PHYHD1Q5SRE7 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PHYHD1Q5SRE7 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PHYHD1Q5SRE7 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PHYHD1Q5SRE7 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PHYHD1Q5SRE7 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PHYHD1Q5SRE7 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PHYHD1Q5SRE7 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PHYHD1Q5SRE7 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70 ms