Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB6CQ53S08 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB6CQ53S08 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB6CQ53S08 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB6CQ53S08 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB6CQ53S08 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB6CQ53S08 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB6CQ53S08 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB6CQ53S08 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB6CQ53S08 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB6CQ53S08 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB6CQ53S08 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB6CQ53S08 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB6CQ53S08 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB6CQ53S08 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms