Protein–RNA interactions for Protein: Q3B7T1

EDRF1, Erythroid differentiation-related factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDRF1Q3B7T1 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
EDRF1Q3B7T1 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
EDRF1Q3B7T1 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
EDRF1Q3B7T1 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
EDRF1Q3B7T1 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
EDRF1Q3B7T1 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
EDRF1Q3B7T1 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
EDRF1Q3B7T1 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
EDRF1Q3B7T1 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms