Protein–RNA interactions for Protein: Q2M243

CCDC27, Coiled-coil domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC27Q2M243 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC27Q2M243 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC27Q2M243 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC27Q2M243 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC27Q2M243 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC27Q2M243 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC27Q2M243 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC27Q2M243 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC27Q2M243 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC27Q2M243 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC27Q2M243 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC27Q2M243 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC27Q2M243 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC27Q2M243 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC27Q2M243 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC27Q2M243 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC27Q2M243 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC27Q2M243 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC27Q2M243 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC27Q2M243 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC27Q2M243 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC27Q2M243 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC27Q2M243 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC27Q2M243 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC27Q2M243 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC27Q2M243 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC27Q2M243 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC27Q2M243 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC27Q2M243 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC27Q2M243 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC27Q2M243 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC27Q2M243 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC27Q2M243 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC27Q2M243 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC27Q2M243 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC27Q2M243 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC27Q2M243 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC27Q2M243 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC27Q2M243 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC27Q2M243 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC27Q2M243 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC27Q2M243 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC27Q2M243 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC27Q2M243 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC27Q2M243 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC27Q2M243 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC27Q2M243 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC27Q2M243 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC27Q2M243 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC27Q2M243 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC27Q2M243 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC27Q2M243 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC27Q2M243 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC27Q2M243 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC27Q2M243 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC27Q2M243 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC27Q2M243 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC27Q2M243 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC27Q2M243 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC27Q2M243 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC27Q2M243 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC27Q2M243 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC27Q2M243 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC27Q2M243 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC27Q2M243 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC27Q2M243 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC27Q2M243 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC27Q2M243 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC27Q2M243 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC27Q2M243 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC27Q2M243 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC27Q2M243 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC27Q2M243 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC27Q2M243 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC27Q2M243 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC27Q2M243 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC27Q2M243 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC27Q2M243 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC27Q2M243 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC27Q2M243 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC27Q2M243 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC27Q2M243 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC27Q2M243 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC27Q2M243 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC27Q2M243 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC27Q2M243 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC27Q2M243 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC27Q2M243 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC27Q2M243 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC27Q2M243 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC27Q2M243 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC27Q2M243 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC27Q2M243 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC27Q2M243 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC27Q2M243 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC27Q2M243 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC27Q2M243 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC27Q2M243 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC27Q2M243 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC27Q2M243 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms