Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms