Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
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