Protein–RNA interactions for Protein: Q15154

PCM1, Pericentriolar material 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,024 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCM1Q15154 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCM1Q15154 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCM1Q15154 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCM1Q15154 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCM1Q15154 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCM1Q15154 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCM1Q15154 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCM1Q15154 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCM1Q15154 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCM1Q15154 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCM1Q15154 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCM1Q15154 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCM1Q15154 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCM1Q15154 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCM1Q15154 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCM1Q15154 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCM1Q15154 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCM1Q15154 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCM1Q15154 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PCM1Q15154 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCM1Q15154 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCM1Q15154 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCM1Q15154 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCM1Q15154 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCM1Q15154 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCM1Q15154 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCM1Q15154 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCM1Q15154 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCM1Q15154 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCM1Q15154 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCM1Q15154 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCM1Q15154 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCM1Q15154 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCM1Q15154 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCM1Q15154 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCM1Q15154 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCM1Q15154 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PCM1Q15154 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCM1Q15154 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCM1Q15154 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCM1Q15154 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCM1Q15154 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCM1Q15154 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCM1Q15154 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCM1Q15154 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCM1Q15154 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCM1Q15154 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCM1Q15154 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCM1Q15154 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCM1Q15154 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms