Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCARF1Q14162 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCARF1Q14162 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCARF1Q14162 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCARF1Q14162 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCARF1Q14162 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCARF1Q14162 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCARF1Q14162 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SCARF1Q14162 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCARF1Q14162 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCARF1Q14162 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCARF1Q14162 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SCARF1Q14162 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCARF1Q14162 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SCARF1Q14162 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SCARF1Q14162 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCARF1Q14162 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCARF1Q14162 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCARF1Q14162 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SCARF1Q14162 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCARF1Q14162 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCARF1Q14162 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCARF1Q14162 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCARF1Q14162 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCARF1Q14162 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCARF1Q14162 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCARF1Q14162 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCARF1Q14162 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCARF1Q14162 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCARF1Q14162 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCARF1Q14162 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCARF1Q14162 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCARF1Q14162 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCARF1Q14162 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCARF1Q14162 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCARF1Q14162 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCARF1Q14162 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCARF1Q14162 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCARF1Q14162 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCARF1Q14162 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCARF1Q14162 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCARF1Q14162 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCARF1Q14162 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCARF1Q14162 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCARF1Q14162 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCARF1Q14162 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCARF1Q14162 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SCARF1Q14162 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCARF1Q14162 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCARF1Q14162 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SCARF1Q14162 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SCARF1Q14162 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCARF1Q14162 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCARF1Q14162 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCARF1Q14162 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SCARF1Q14162 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCARF1Q14162 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCARF1Q14162 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCARF1Q14162 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCARF1Q14162 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCARF1Q14162 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCARF1Q14162 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCARF1Q14162 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCARF1Q14162 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCARF1Q14162 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCARF1Q14162 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCARF1Q14162 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SCARF1Q14162 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCARF1Q14162 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCARF1Q14162 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCARF1Q14162 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCARF1Q14162 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCARF1Q14162 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCARF1Q14162 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCARF1Q14162 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCARF1Q14162 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCARF1Q14162 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCARF1Q14162 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCARF1Q14162 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCARF1Q14162 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCARF1Q14162 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCARF1Q14162 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCARF1Q14162 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCARF1Q14162 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCARF1Q14162 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCARF1Q14162 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCARF1Q14162 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCARF1Q14162 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCARF1Q14162 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SCARF1Q14162 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SCARF1Q14162 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCARF1Q14162 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCARF1Q14162 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCARF1Q14162 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCARF1Q14162 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCARF1Q14162 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCARF1Q14162 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCARF1Q14162 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SCARF1Q14162 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SCARF1Q14162 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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